Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
NAE1Q13564 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NAE1Q13564 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
NAE1Q13564 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
NAE1Q13564 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NAE1Q13564 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NAE1Q13564 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
NAE1Q13564 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
NAE1Q13564 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NAE1Q13564 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NAE1Q13564 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NAE1Q13564 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NAE1Q13564 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NAE1Q13564 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
NAE1Q13564 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
NAE1Q13564 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NAE1Q13564 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NAE1Q13564 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NAE1Q13564 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
NAE1Q13564 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
NAE1Q13564 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NAE1Q13564 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NAE1Q13564 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
NAE1Q13564 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NAE1Q13564 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NAE1Q13564 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
NAE1Q13564 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NAE1Q13564 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NAE1Q13564 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NAE1Q13564 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NAE1Q13564 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NAE1Q13564 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
NAE1Q13564 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NAE1Q13564 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NAE1Q13564 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NAE1Q13564 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NAE1Q13564 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NAE1Q13564 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NAE1Q13564 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NAE1Q13564 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NAE1Q13564 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NAE1Q13564 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NAE1Q13564 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NAE1Q13564 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NAE1Q13564 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NAE1Q13564 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NAE1Q13564 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
NAE1Q13564 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
NAE1Q13564 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NAE1Q13564 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NAE1Q13564 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NAE1Q13564 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NAE1Q13564 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NAE1Q13564 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NAE1Q13564 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NAE1Q13564 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NAE1Q13564 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NAE1Q13564 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NAE1Q13564 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NAE1Q13564 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NAE1Q13564 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
NAE1Q13564 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
NAE1Q13564 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
NAE1Q13564 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
NAE1Q13564 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NAE1Q13564 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
NAE1Q13564 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NAE1Q13564 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
NAE1Q13564 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NAE1Q13564 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NAE1Q13564 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NAE1Q13564 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NAE1Q13564 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NAE1Q13564 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NAE1Q13564 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NAE1Q13564 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
NAE1Q13564 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
NAE1Q13564 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
NAE1Q13564 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
NAE1Q13564 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NAE1Q13564 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NAE1Q13564 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NAE1Q13564 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NAE1Q13564 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NAE1Q13564 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NAE1Q13564 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
NAE1Q13564 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
NAE1Q13564 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NAE1Q13564 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NAE1Q13564 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NAE1Q13564 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
NAE1Q13564 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NAE1Q13564 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
NAE1Q13564 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NAE1Q13564 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NAE1Q13564 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NAE1Q13564 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
NAE1Q13564 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NAE1Q13564 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NAE1Q13564 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
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