Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
NEUROD1Q13562 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
NEUROD1Q13562 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
NEUROD1Q13562 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
NEUROD1Q13562 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
NEUROD1Q13562 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
NEUROD1Q13562 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
NEUROD1Q13562 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
NEUROD1Q13562 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
NEUROD1Q13562 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
NEUROD1Q13562 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
NEUROD1Q13562 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
NEUROD1Q13562 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
NEUROD1Q13562 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
NEUROD1Q13562 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
NEUROD1Q13562 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
NEUROD1Q13562 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
NEUROD1Q13562 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
NEUROD1Q13562 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
NEUROD1Q13562 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
NEUROD1Q13562 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
NEUROD1Q13562 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
NEUROD1Q13562 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
NEUROD1Q13562 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
NEUROD1Q13562 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
NEUROD1Q13562 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
NEUROD1Q13562 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
NEUROD1Q13562 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
NEUROD1Q13562 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
NEUROD1Q13562 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
NEUROD1Q13562 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
NEUROD1Q13562 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
NEUROD1Q13562 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
NEUROD1Q13562 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
NEUROD1Q13562 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
NEUROD1Q13562 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
NEUROD1Q13562 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
NEUROD1Q13562 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
NEUROD1Q13562 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.72
NEUROD1Q13562 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.72
NEUROD1Q13562 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
NEUROD1Q13562 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
NEUROD1Q13562 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
NEUROD1Q13562 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
NEUROD1Q13562 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
NEUROD1Q13562 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
NEUROD1Q13562 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
NEUROD1Q13562 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
NEUROD1Q13562 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
NEUROD1Q13562 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
NEUROD1Q13562 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
NEUROD1Q13562 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
NEUROD1Q13562 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
NEUROD1Q13562 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
NEUROD1Q13562 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
NEUROD1Q13562 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
NEUROD1Q13562 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
NEUROD1Q13562 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
NEUROD1Q13562 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
NEUROD1Q13562 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
NEUROD1Q13562 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
NEUROD1Q13562 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
NEUROD1Q13562 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
NEUROD1Q13562 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
NEUROD1Q13562 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
NEUROD1Q13562 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
NEUROD1Q13562 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
NEUROD1Q13562 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
NEUROD1Q13562 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
NEUROD1Q13562 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
NEUROD1Q13562 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
NEUROD1Q13562 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
NEUROD1Q13562 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
NEUROD1Q13562 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
NEUROD1Q13562 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
NEUROD1Q13562 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
NEUROD1Q13562 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
NEUROD1Q13562 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
NEUROD1Q13562 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
NEUROD1Q13562 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
NEUROD1Q13562 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
NEUROD1Q13562 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
NEUROD1Q13562 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
NEUROD1Q13562 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
NEUROD1Q13562 AC022081.1-201ENST00000537327 433 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
NEUROD1Q13562 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
NEUROD1Q13562 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
NEUROD1Q13562 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
NEUROD1Q13562 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
NEUROD1Q13562 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
NEUROD1Q13562 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
NEUROD1Q13562 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
NEUROD1Q13562 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
NEUROD1Q13562 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
NEUROD1Q13562 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
NEUROD1Q13562 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
NEUROD1Q13562 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
NEUROD1Q13562 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
NEUROD1Q13562 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
NEUROD1Q13562 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.7 ms