Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.24□□□□□ -2.37
ITGB3BPQ13352 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ITGB3BPQ13352 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ITGB3BPQ13352 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.23□□□□□ -2.37
ITGB3BPQ13352 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ITGB3BPQ13352 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ITGB3BPQ13352 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ITGB3BPQ13352 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ITGB3BPQ13352 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ITGB3BPQ13352 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC0.23□□□□□ -2.37
ITGB3BPQ13352 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.23□□□□□ -2.37
ITGB3BPQ13352 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ITGB3BPQ13352 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ITGB3BPQ13352 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ITGB3BPQ13352 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ITGB3BPQ13352 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ITGB3BPQ13352 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.23□□□□□ -2.37
ITGB3BPQ13352 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC0.23□□□□□ -2.37
ITGB3BPQ13352 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ITGB3BPQ13352 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ITGB3BPQ13352 AL021368.1-201ENST00000607490 540 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ITGB3BPQ13352 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ITGB3BPQ13352 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ITGB3BPQ13352 PPP2R2A-224ENST00000640787 318 ntTSL 5 BASIC0.23□□□□□ -2.37
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ITGB3BPQ13352 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ITGB3BPQ13352 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ITGB3BPQ13352 AL354692.1-201ENST00000423044 315 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ITGB3BPQ13352 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC0.22□□□□□ -2.37
ITGB3BPQ13352 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ITGB3BPQ13352 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC0.22□□□□□ -2.37
ITGB3BPQ13352 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ITGB3BPQ13352 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ITGB3BPQ13352 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ITGB3BPQ13352 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ITGB3BPQ13352 BNIP3P40-201ENST00000596017 556 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ITGB3BPQ13352 AL158042.1-201ENST00000605338 460 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ITGB3BPQ13352 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ITGB3BPQ13352 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ITGB3BPQ13352 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ITGB3BPQ13352 UGP2-231ENST00000627474 264 ntTSL 5 BASIC0.22□□□□□ -2.37
ITGB3BPQ13352 AL445984.1-201ENST00000637834 659 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ITGB3BPQ13352 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ITGB3BPQ13352 RNU4-92P-201ENST00000363783 136 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ITGB3BPQ13352 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ITGB3BPQ13352 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ITGB3BPQ13352 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ITGB3BPQ13352 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC0.21□□□□□ -2.38
ITGB3BPQ13352 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ITGB3BPQ13352 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ITGB3BPQ13352 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ITGB3BPQ13352 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ITGB3BPQ13352 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ITGB3BPQ13352 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC0.21□□□□□ -2.38
ITGB3BPQ13352 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ITGB3BPQ13352 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ITGB3BPQ13352 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ITGB3BPQ13352 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ITGB3BPQ13352 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ITGB3BPQ13352 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ITGB3BPQ13352 ZNF736P4Y-201ENST00000454995 1243 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ITGB3BPQ13352 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ITGB3BPQ13352 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ITGB3BPQ13352 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ITGB3BPQ13352 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ITGB3BPQ13352 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ITGB3BPQ13352 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ITGB3BPQ13352 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ITGB3BPQ13352 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC0.19□□□□□ -2.38
ITGB3BPQ13352 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ITGB3BPQ13352 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ITGB3BPQ13352 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ITGB3BPQ13352 AC016550.1-201ENST00000505348 785 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ITGB3BPQ13352 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ITGB3BPQ13352 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ITGB3BPQ13352 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ITGB3BPQ13352 RNU5E-10P-201ENST00000363506 118 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ITGB3BPQ13352 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ITGB3BPQ13352 RNU6-757P-201ENST00000410334 100 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ITGB3BPQ13352 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ITGB3BPQ13352 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ITGB3BPQ13352 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ITGB3BPQ13352 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC0.18□□□□□ -2.38
ITGB3BPQ13352 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ITGB3BPQ13352 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ITGB3BPQ13352 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ITGB3BPQ13352 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ITGB3BPQ13352 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ITGB3BPQ13352 AL670729.3-201ENST00000602345 574 ntTSL 4 BASIC0.18□□□□□ -2.38
ITGB3BPQ13352 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ITGB3BPQ13352 AL158211.2-201ENST00000607282 395 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ITGB3BPQ13352 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ITGB3BPQ13352 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ITGB3BPQ13352 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ITGB3BPQ13352 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ITGB3BPQ13352 EXOSC3P1-201ENST00000448649 500 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ITGB3BPQ13352 AL355314.1-201ENST00000453639 316 ntTSL 5 BASIC0.17□□□□□ -2.38
ITGB3BPQ13352 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC0.17□□□□□ -2.38
ITGB3BPQ13352 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144 ms