Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SGCGQ13326 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SGCGQ13326 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SGCGQ13326 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SGCGQ13326 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SGCGQ13326 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
SGCGQ13326 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SGCGQ13326 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SGCGQ13326 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SGCGQ13326 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SGCGQ13326 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SGCGQ13326 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SGCGQ13326 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SGCGQ13326 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SGCGQ13326 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SGCGQ13326 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SGCGQ13326 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SGCGQ13326 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SGCGQ13326 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SGCGQ13326 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SGCGQ13326 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SGCGQ13326 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SGCGQ13326 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SGCGQ13326 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SGCGQ13326 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SGCGQ13326 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SGCGQ13326 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SGCGQ13326 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SGCGQ13326 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SGCGQ13326 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SGCGQ13326 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SGCGQ13326 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SGCGQ13326 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SGCGQ13326 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SGCGQ13326 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SGCGQ13326 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SGCGQ13326 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SGCGQ13326 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 176.2 ms