Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CBX3Q13185 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CBX3Q13185 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CBX3Q13185 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
CBX3Q13185 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CBX3Q13185 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CBX3Q13185 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
CBX3Q13185 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
CBX3Q13185 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CBX3Q13185 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CBX3Q13185 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CBX3Q13185 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CBX3Q13185 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CBX3Q13185 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.46□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC1.46□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 GACAT1-202ENST00000441383 540 ntTSL 4 BASIC1.46□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC1.46□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.45□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
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