Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NR1H3Q13133 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NR1H3Q13133 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NR1H3Q13133 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NR1H3Q13133 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NR1H3Q13133 MIR1251-201ENST00000408552 70 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NR1H3Q13133 TBCAP1-201ENST00000436520 327 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NR1H3Q13133 RN7SL93P-201ENST00000463035 293 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NR1H3Q13133 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NR1H3Q13133 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NR1H3Q13133 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NR1H3Q13133 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NR1H3Q13133 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NR1H3Q13133 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NR1H3Q13133 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
NR1H3Q13133 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
NR1H3Q13133 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
NR1H3Q13133 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
NR1H3Q13133 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
NR1H3Q13133 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
NR1H3Q13133 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
NR1H3Q13133 DST-201ENST00000244364 16742 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
NR1H3Q13133 OTUD4P1-201ENST00000237841 3067 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NR1H3Q13133 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
NR1H3Q13133 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NR1H3Q13133 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NR1H3Q13133 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NR1H3Q13133 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
NR1H3Q13133 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NR1H3Q13133 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NR1H3Q13133 RN7SL323P-201ENST00000494712 295 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NR1H3Q13133 AC026726.1-201ENST00000512859 601 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NR1H3Q13133 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
NR1H3Q13133 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
NR1H3Q13133 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
NR1H3Q13133 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
NR1H3Q13133 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
NR1H3Q13133 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
NR1H3Q13133 ZFYVE16-201ENST00000338008 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
NR1H3Q13133 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
NR1H3Q13133 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
NR1H3Q13133 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
NR1H3Q13133 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
NR1H3Q13133 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
NR1H3Q13133 AL138878.1-201ENST00000405131 347 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
NR1H3Q13133 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
NR1H3Q13133 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
NR1H3Q13133 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
NR1H3Q13133 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
NR1H3Q13133 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
NR1H3Q13133 RNA5SP179-201ENST00000517284 121 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
NR1H3Q13133 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
NR1H3Q13133 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
NR1H3Q13133 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
NR1H3Q13133 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
NR1H3Q13133 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
NR1H3Q13133 DAZ4-206ENST00000449750 3271 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
NR1H3Q13133 ADGRL4-201ENST00000370742 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
NR1H3Q13133 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
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NR1H3Q13133 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
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NR1H3Q13133 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
NR1H3Q13133 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
NR1H3Q13133 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
NR1H3Q13133 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
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NR1H3Q13133 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
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NR1H3Q13133 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
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NR1H3Q13133 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
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NR1H3Q13133 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
NR1H3Q13133 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
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NR1H3Q13133 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
NR1H3Q13133 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
NR1H3Q13133 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
NR1H3Q13133 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
NR1H3Q13133 PIGN-240ENST00000639912 6530 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
NR1H3Q13133 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
NR1H3Q13133 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
NR1H3Q13133 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
NR1H3Q13133 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
NR1H3Q13133 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
NR1H3Q13133 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
NR1H3Q13133 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
NR1H3Q13133 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
NR1H3Q13133 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
NR1H3Q13133 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
NR1H3Q13133 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
NR1H3Q13133 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
NR1H3Q13133 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
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