Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
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