Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
IFT88Q13099 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
IFT88Q13099 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
IFT88Q13099 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
IFT88Q13099 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC1.25□□□□□ -2.21
IFT88Q13099 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
IFT88Q13099 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
IFT88Q13099 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
IFT88Q13099 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
IFT88Q13099 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
IFT88Q13099 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
IFT88Q13099 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
IFT88Q13099 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
IFT88Q13099 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
IFT88Q13099 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
IFT88Q13099 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
IFT88Q13099 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
IFT88Q13099 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
IFT88Q13099 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
IFT88Q13099 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
IFT88Q13099 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
IFT88Q13099 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
IFT88Q13099 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
IFT88Q13099 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
IFT88Q13099 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
IFT88Q13099 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
IFT88Q13099 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
IFT88Q13099 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
IFT88Q13099 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
IFT88Q13099 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
IFT88Q13099 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
IFT88Q13099 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
IFT88Q13099 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
IFT88Q13099 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
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IFT88Q13099 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
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IFT88Q13099 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
IFT88Q13099 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
IFT88Q13099 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
IFT88Q13099 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
IFT88Q13099 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
IFT88Q13099 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
IFT88Q13099 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
IFT88Q13099 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
IFT88Q13099 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
IFT88Q13099 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
IFT88Q13099 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
IFT88Q13099 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
IFT88Q13099 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
IFT88Q13099 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
IFT88Q13099 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
IFT88Q13099 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
IFT88Q13099 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
IFT88Q13099 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
IFT88Q13099 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
IFT88Q13099 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
IFT88Q13099 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
IFT88Q13099 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
IFT88Q13099 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
IFT88Q13099 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
IFT88Q13099 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
IFT88Q13099 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
IFT88Q13099 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
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