Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GRIK2Q13002 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
GRIK2Q13002 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GRIK2Q13002 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
GRIK2Q13002 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GRIK2Q13002 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GRIK2Q13002 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GRIK2Q13002 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GRIK2Q13002 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GRIK2Q13002 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GRIK2Q13002 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GRIK2Q13002 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
GRIK2Q13002 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GRIK2Q13002 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GRIK2Q13002 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GRIK2Q13002 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GRIK2Q13002 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GRIK2Q13002 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GRIK2Q13002 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GRIK2Q13002 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GRIK2Q13002 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GRIK2Q13002 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
GRIK2Q13002 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GRIK2Q13002 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
GRIK2Q13002 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
GRIK2Q13002 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GRIK2Q13002 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GRIK2Q13002 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GRIK2Q13002 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
GRIK2Q13002 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GRIK2Q13002 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GRIK2Q13002 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
GRIK2Q13002 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GRIK2Q13002 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
GRIK2Q13002 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
GRIK2Q13002 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GRIK2Q13002 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GRIK2Q13002 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GRIK2Q13002 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GRIK2Q13002 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GRIK2Q13002 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GRIK2Q13002 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GRIK2Q13002 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GRIK2Q13002 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GRIK2Q13002 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GRIK2Q13002 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GRIK2Q13002 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GRIK2Q13002 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GRIK2Q13002 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
GRIK2Q13002 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
GRIK2Q13002 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GRIK2Q13002 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
GRIK2Q13002 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GRIK2Q13002 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GRIK2Q13002 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GRIK2Q13002 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GRIK2Q13002 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GRIK2Q13002 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GRIK2Q13002 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
GRIK2Q13002 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GRIK2Q13002 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
GRIK2Q13002 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GRIK2Q13002 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GRIK2Q13002 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GRIK2Q13002 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GRIK2Q13002 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GRIK2Q13002 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GRIK2Q13002 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
GRIK2Q13002 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
GRIK2Q13002 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
GRIK2Q13002 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
GRIK2Q13002 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
GRIK2Q13002 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GRIK2Q13002 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GRIK2Q13002 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GRIK2Q13002 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GRIK2Q13002 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GRIK2Q13002 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GRIK2Q13002 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GRIK2Q13002 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GRIK2Q13002 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GRIK2Q13002 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GRIK2Q13002 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GRIK2Q13002 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GRIK2Q13002 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GRIK2Q13002 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
GRIK2Q13002 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GRIK2Q13002 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GRIK2Q13002 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GRIK2Q13002 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GRIK2Q13002 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GRIK2Q13002 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GRIK2Q13002 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GRIK2Q13002 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
GRIK2Q13002 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
GRIK2Q13002 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GRIK2Q13002 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GRIK2Q13002 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GRIK2Q13002 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GRIK2Q13002 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.1 ms