Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC1.53□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC1.52□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC1.52□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 271.5 ms