Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.8 ms