Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPRBP23467 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPRBP23467 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPRBP23467 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPRBP23467 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPRBP23467 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPRBP23467 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPRBP23467 RNU6-584P-201ENST00000410350 95 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPRBP23467 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPRBP23467 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPRBP23467 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
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PTPRBP23467 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPRBP23467 AL133217.1-201ENST00000450980 425 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPRBP23467 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPRBP23467 AC092958.2-201ENST00000476987 492 ntTSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPRBP23467 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPRBP23467 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPRBP23467 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPRBP23467 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPRBP23467 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
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PTPRBP23467 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPRBP23467 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPRBP23467 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPRBP23467 MTND4P9-201ENST00000507819 1346 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPRBP23467 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
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PTPRBP23467 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPRBP23467 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPRBP23467 AC090960.1-201ENST00000421072 306 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
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PTPRBP23467 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC0.56□□□□□ -2.32
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PTPRBP23467 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPRBP23467 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPRBP23467 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPRBP23467 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPRBP23467 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPRBP23467 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRBP23467 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRBP23467 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRBP23467 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRBP23467 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRBP23467 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRBP23467 MIR513B-201ENST00000385136 84 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRBP23467 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.55□□□□□ -2.32
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