Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRCP08575 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRCP08575 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRCP08575 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRCP08575 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRCP08575 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRCP08575 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRCP08575 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRCP08575 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
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PTPRCP08575 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRCP08575 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRCP08575 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
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PTPRCP08575 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
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PTPRCP08575 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRCP08575 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRCP08575 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRCP08575 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRCP08575 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRCP08575 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRCP08575 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRCP08575 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRCP08575 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRCP08575 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRCP08575 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPRCP08575 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
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PTPRCP08575 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPRCP08575 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPRCP08575 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPRCP08575 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPRCP08575 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPRCP08575 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPRCP08575 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPRCP08575 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPRCP08575 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPRCP08575 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPRCP08575 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPRCP08575 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPRCP08575 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
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PTPRCP08575 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPRCP08575 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
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PTPRCP08575 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
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PTPRCP08575 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPRCP08575 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
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PTPRCP08575 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPRCP08575 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPRCP08575 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
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PTPRCP08575 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPRCP08575 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPRCP08575 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
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PTPRCP08575 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
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PTPRCP08575 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
PTPRCP08575 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
PTPRCP08575 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
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PTPRCP08575 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
PTPRCP08575 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PTPRCP08575 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
PTPRCP08575 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPRCP08575 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPRCP08575 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPRCP08575 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPRCP08575 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPRCP08575 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
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PTPRCP08575 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
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PTPRCP08575 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPRCP08575 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPRCP08575 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
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