Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 AC002075.2-201ENST00000425207 252 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
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HOXA3O43365 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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