Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

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Length 774 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HCN3Q9P1Z3 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HCN3Q9P1Z3 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
HCN3Q9P1Z3 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
HCN3Q9P1Z3 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
HCN3Q9P1Z3 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
HCN3Q9P1Z3 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HCN3Q9P1Z3 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HCN3Q9P1Z3 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HCN3Q9P1Z3 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
HCN3Q9P1Z3 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HCN3Q9P1Z3 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HCN3Q9P1Z3 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HCN3Q9P1Z3 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
HCN3Q9P1Z3 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
HCN3Q9P1Z3 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HCN3Q9P1Z3 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HCN3Q9P1Z3 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HCN3Q9P1Z3 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
HCN3Q9P1Z3 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
HCN3Q9P1Z3 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
HCN3Q9P1Z3 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
HCN3Q9P1Z3 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HCN3Q9P1Z3 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HCN3Q9P1Z3 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HCN3Q9P1Z3 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HCN3Q9P1Z3 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HCN3Q9P1Z3 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HCN3Q9P1Z3 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HCN3Q9P1Z3 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HCN3Q9P1Z3 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HCN3Q9P1Z3 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HCN3Q9P1Z3 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HCN3Q9P1Z3 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HCN3Q9P1Z3 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
HCN3Q9P1Z3 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HCN3Q9P1Z3 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
HCN3Q9P1Z3 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HCN3Q9P1Z3 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HCN3Q9P1Z3 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
HCN3Q9P1Z3 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
HCN3Q9P1Z3 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
HCN3Q9P1Z3 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
HCN3Q9P1Z3 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HCN3Q9P1Z3 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HCN3Q9P1Z3 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HCN3Q9P1Z3 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HCN3Q9P1Z3 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HCN3Q9P1Z3 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HCN3Q9P1Z3 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
HCN3Q9P1Z3 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HCN3Q9P1Z3 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HCN3Q9P1Z3 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HCN3Q9P1Z3 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
HCN3Q9P1Z3 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
HCN3Q9P1Z3 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HCN3Q9P1Z3 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HCN3Q9P1Z3 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HCN3Q9P1Z3 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
HCN3Q9P1Z3 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
HCN3Q9P1Z3 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HCN3Q9P1Z3 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HCN3Q9P1Z3 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HCN3Q9P1Z3 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
HCN3Q9P1Z3 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
HCN3Q9P1Z3 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HCN3Q9P1Z3 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HCN3Q9P1Z3 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HCN3Q9P1Z3 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HCN3Q9P1Z3 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HCN3Q9P1Z3 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HCN3Q9P1Z3 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HCN3Q9P1Z3 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HCN3Q9P1Z3 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HCN3Q9P1Z3 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HCN3Q9P1Z3 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HCN3Q9P1Z3 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HCN3Q9P1Z3 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
HCN3Q9P1Z3 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
HCN3Q9P1Z3 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HCN3Q9P1Z3 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
HCN3Q9P1Z3 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HCN3Q9P1Z3 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HCN3Q9P1Z3 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HCN3Q9P1Z3 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HCN3Q9P1Z3 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HCN3Q9P1Z3 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HCN3Q9P1Z3 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
HCN3Q9P1Z3 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
HCN3Q9P1Z3 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
HCN3Q9P1Z3 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HCN3Q9P1Z3 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HCN3Q9P1Z3 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HCN3Q9P1Z3 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HCN3Q9P1Z3 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HCN3Q9P1Z3 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HCN3Q9P1Z3 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HCN3Q9P1Z3 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HCN3Q9P1Z3 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HCN3Q9P1Z3 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
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