Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR4433B-201ENST00000581329 102 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC005154.1-203ENST00000626245 451 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 KIAA1549L-202ENST00000321505 11678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF521-201ENST00000361524 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 FBXW2-205ENST00000608872 9138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 GABRB2-201ENST00000274547 7409 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 MEF2C-202ENST00000424173 6336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 OR2AT4-204ENST00000641593 8733 ntAPPRIS P1 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 BBX-201ENST00000325805 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 DDX6-208ENST00000620157 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC011912.1-201ENST00000623483 5819 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
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KRTAP9-3Q9BYQ3 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
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KRTAP9-3Q9BYQ3 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
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KRTAP9-3Q9BYQ3 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 TTC3-201ENST00000354749 9084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
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KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM8B-202ENST00000377991 14112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
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KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC1A2-202ENST00000395750 11538 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
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KRTAP9-3Q9BYQ3 CPEB4-201ENST00000265085 9483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC133552.1-201ENST00000569988 4007 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 DNHD1-201ENST00000254579 14862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 GHR-210ENST00000615111 4814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 FRK-201ENST00000606080 13230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 UPF2-201ENST00000356352 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 ATP5S-202ENST00000311459 10212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 KIAA0586-203ENST00000423743 5339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 RALGAPA2-201ENST00000202677 6152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
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