Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 AC098826.2-201ENST00000452011 651 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.16□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC1.16□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC1.15□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC1.14□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC1.14□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC1.14□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
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