Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.3 ms