Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
USP43Q70EL4 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
USP43Q70EL4 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
USP43Q70EL4 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
USP43Q70EL4 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
USP43Q70EL4 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
USP43Q70EL4 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
USP43Q70EL4 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
USP43Q70EL4 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
USP43Q70EL4 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
USP43Q70EL4 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
USP43Q70EL4 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
USP43Q70EL4 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
USP43Q70EL4 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
USP43Q70EL4 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
USP43Q70EL4 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
USP43Q70EL4 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
USP43Q70EL4 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
USP43Q70EL4 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
USP43Q70EL4 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC2.5□□□□□ -2.01
USP43Q70EL4 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
USP43Q70EL4 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
USP43Q70EL4 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
USP43Q70EL4 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
USP43Q70EL4 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
USP43Q70EL4 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC2.5□□□□□ -2.01
USP43Q70EL4 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
USP43Q70EL4 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
USP43Q70EL4 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
USP43Q70EL4 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
USP43Q70EL4 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
USP43Q70EL4 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
USP43Q70EL4 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
USP43Q70EL4 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
USP43Q70EL4 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
USP43Q70EL4 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
USP43Q70EL4 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
USP43Q70EL4 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
USP43Q70EL4 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
USP43Q70EL4 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
USP43Q70EL4 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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USP43Q70EL4 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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USP43Q70EL4 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
USP43Q70EL4 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
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USP43Q70EL4 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
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USP43Q70EL4 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
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USP43Q70EL4 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
USP43Q70EL4 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
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USP43Q70EL4 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
USP43Q70EL4 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
USP43Q70EL4 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
USP43Q70EL4 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
USP43Q70EL4 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
USP43Q70EL4 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
USP43Q70EL4 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
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USP43Q70EL4 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
USP43Q70EL4 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
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USP43Q70EL4 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
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USP43Q70EL4 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
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USP43Q70EL4 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
USP43Q70EL4 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
USP43Q70EL4 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
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USP43Q70EL4 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
USP43Q70EL4 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
USP43Q70EL4 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
USP43Q70EL4 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
USP43Q70EL4 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
USP43Q70EL4 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
USP43Q70EL4 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
USP43Q70EL4 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
USP43Q70EL4 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
USP43Q70EL4 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
USP43Q70EL4 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
USP43Q70EL4 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
USP43Q70EL4 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
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