Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVS0

C1orf140, Putative uncharacterized protein C1orf140, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf140Q5VVS0 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
C1orf140Q5VVS0 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
C1orf140Q5VVS0 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
C1orf140Q5VVS0 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.1□□□□□ -2.39
C1orf140Q5VVS0 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
C1orf140Q5VVS0 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
C1orf140Q5VVS0 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
C1orf140Q5VVS0 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
C1orf140Q5VVS0 AL391863.2-201ENST00000411838 681 ntTSL 2 BASIC0.1□□□□□ -2.39
C1orf140Q5VVS0 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
C1orf140Q5VVS0 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC0.1□□□□□ -2.39
C1orf140Q5VVS0 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
C1orf140Q5VVS0 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC0.1□□□□□ -2.39
C1orf140Q5VVS0 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
C1orf140Q5VVS0 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
C1orf140Q5VVS0 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC0.1□□□□□ -2.39
C1orf140Q5VVS0 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
C1orf140Q5VVS0 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
C1orf140Q5VVS0 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC0.1□□□□□ -2.39
C1orf140Q5VVS0 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
C1orf140Q5VVS0 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
C1orf140Q5VVS0 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
C1orf140Q5VVS0 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
C1orf140Q5VVS0 AP000484.1-201ENST00000620067 1252 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
C1orf140Q5VVS0 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC0.1□□□□□ -2.39
C1orf140Q5VVS0 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
C1orf140Q5VVS0 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC0.09□□□□□ -2.39
C1orf140Q5VVS0 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
C1orf140Q5VVS0 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
C1orf140Q5VVS0 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
C1orf140Q5VVS0 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
C1orf140Q5VVS0 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC0.09□□□□□ -2.4
C1orf140Q5VVS0 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
C1orf140Q5VVS0 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
C1orf140Q5VVS0 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
C1orf140Q5VVS0 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
C1orf140Q5VVS0 AC069114.1-201ENST00000580927 287 ntTSL 2 BASIC0.09□□□□□ -2.4
C1orf140Q5VVS0 AL670729.3-201ENST00000602345 574 ntTSL 4 BASIC0.09□□□□□ -2.4
C1orf140Q5VVS0 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
C1orf140Q5VVS0 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC0.09□□□□□ -2.4
C1orf140Q5VVS0 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
C1orf140Q5VVS0 PART1_2.1-201ENST00000612397 250 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
C1orf140Q5VVS0 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
C1orf140Q5VVS0 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC0.09□□□□□ -2.4
C1orf140Q5VVS0 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.08□□□□□ -2.4
C1orf140Q5VVS0 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
C1orf140Q5VVS0 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
C1orf140Q5VVS0 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
C1orf140Q5VVS0 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
C1orf140Q5VVS0 LANCL1-AS1-202ENST00000420418 476 ntTSL 3 BASIC0.08□□□□□ -2.4
C1orf140Q5VVS0 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
C1orf140Q5VVS0 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
C1orf140Q5VVS0 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
C1orf140Q5VVS0 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
C1orf140Q5VVS0 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC0.08□□□□□ -2.4
C1orf140Q5VVS0 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
C1orf140Q5VVS0 AC010486.2-201ENST00000505572 483 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
C1orf140Q5VVS0 AC027335.1-201ENST00000515377 543 ntTSL 4 BASIC0.08□□□□□ -2.4
C1orf140Q5VVS0 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
C1orf140Q5VVS0 AL592221.1-201ENST00000605266 382 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
C1orf140Q5VVS0 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
C1orf140Q5VVS0 AC019226.2-201ENST00000625973 424 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
C1orf140Q5VVS0 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
C1orf140Q5VVS0 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
C1orf140Q5VVS0 AC134980.1-208ENST00000640228 535 ntTSL 5 BASIC0.08□□□□□ -2.4
C1orf140Q5VVS0 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC0.07□□□□□ -2.4
C1orf140Q5VVS0 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
C1orf140Q5VVS0 SNORD116.1-201ENST00000365628 92 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
C1orf140Q5VVS0 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
C1orf140Q5VVS0 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC0.07□□□□□ -2.4
C1orf140Q5VVS0 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
C1orf140Q5VVS0 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC0.07□□□□□ -2.4
C1orf140Q5VVS0 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
C1orf140Q5VVS0 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
C1orf140Q5VVS0 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC0.07□□□□□ -2.4
C1orf140Q5VVS0 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC0.07□□□□□ -2.4
C1orf140Q5VVS0 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
C1orf140Q5VVS0 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
C1orf140Q5VVS0 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
C1orf140Q5VVS0 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC0.07□□□□□ -2.4
C1orf140Q5VVS0 AP000568.1-201ENST00000282964 442 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
C1orf140Q5VVS0 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
C1orf140Q5VVS0 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
C1orf140Q5VVS0 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
C1orf140Q5VVS0 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
C1orf140Q5VVS0 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
C1orf140Q5VVS0 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
C1orf140Q5VVS0 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
C1orf140Q5VVS0 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC0.06□□□□□ -2.4
C1orf140Q5VVS0 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
C1orf140Q5VVS0 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC0.06□□□□□ -2.4
C1orf140Q5VVS0 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
C1orf140Q5VVS0 AP003969.1-201ENST00000531846 400 ntTSL 2 BASIC0.06□□□□□ -2.4
C1orf140Q5VVS0 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
C1orf140Q5VVS0 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
C1orf140Q5VVS0 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
C1orf140Q5VVS0 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
C1orf140Q5VVS0 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC0.05□□□□□ -2.4
C1orf140Q5VVS0 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
C1orf140Q5VVS0 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.9 ms