Protein–RNA interactions for Protein: Q2Q1W2

TRIM71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM71Q2Q1W2 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRIM71Q2Q1W2 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRIM71Q2Q1W2 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRIM71Q2Q1W2 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRIM71Q2Q1W2 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRIM71Q2Q1W2 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRIM71Q2Q1W2 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRIM71Q2Q1W2 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRIM71Q2Q1W2 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRIM71Q2Q1W2 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRIM71Q2Q1W2 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRIM71Q2Q1W2 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRIM71Q2Q1W2 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TRIM71Q2Q1W2 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRIM71Q2Q1W2 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRIM71Q2Q1W2 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRIM71Q2Q1W2 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRIM71Q2Q1W2 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TRIM71Q2Q1W2 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRIM71Q2Q1W2 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRIM71Q2Q1W2 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRIM71Q2Q1W2 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRIM71Q2Q1W2 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRIM71Q2Q1W2 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRIM71Q2Q1W2 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRIM71Q2Q1W2 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
TRIM71Q2Q1W2 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TRIM71Q2Q1W2 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TRIM71Q2Q1W2 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TRIM71Q2Q1W2 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
TRIM71Q2Q1W2 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
TRIM71Q2Q1W2 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TRIM71Q2Q1W2 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TRIM71Q2Q1W2 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TRIM71Q2Q1W2 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TRIM71Q2Q1W2 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TRIM71Q2Q1W2 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TRIM71Q2Q1W2 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TRIM71Q2Q1W2 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TRIM71Q2Q1W2 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TRIM71Q2Q1W2 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TRIM71Q2Q1W2 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TRIM71Q2Q1W2 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TRIM71Q2Q1W2 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TRIM71Q2Q1W2 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TRIM71Q2Q1W2 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TRIM71Q2Q1W2 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TRIM71Q2Q1W2 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TRIM71Q2Q1W2 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TRIM71Q2Q1W2 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TRIM71Q2Q1W2 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TRIM71Q2Q1W2 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
TRIM71Q2Q1W2 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TRIM71Q2Q1W2 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TRIM71Q2Q1W2 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TRIM71Q2Q1W2 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
TRIM71Q2Q1W2 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
TRIM71Q2Q1W2 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
TRIM71Q2Q1W2 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRIM71Q2Q1W2 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRIM71Q2Q1W2 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRIM71Q2Q1W2 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRIM71Q2Q1W2 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRIM71Q2Q1W2 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRIM71Q2Q1W2 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRIM71Q2Q1W2 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRIM71Q2Q1W2 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRIM71Q2Q1W2 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRIM71Q2Q1W2 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRIM71Q2Q1W2 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRIM71Q2Q1W2 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TRIM71Q2Q1W2 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TRIM71Q2Q1W2 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRIM71Q2Q1W2 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TRIM71Q2Q1W2 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRIM71Q2Q1W2 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRIM71Q2Q1W2 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRIM71Q2Q1W2 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRIM71Q2Q1W2 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRIM71Q2Q1W2 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRIM71Q2Q1W2 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRIM71Q2Q1W2 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRIM71Q2Q1W2 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
TRIM71Q2Q1W2 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.96
TRIM71Q2Q1W2 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
TRIM71Q2Q1W2 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
TRIM71Q2Q1W2 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TRIM71Q2Q1W2 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TRIM71Q2Q1W2 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TRIM71Q2Q1W2 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TRIM71Q2Q1W2 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TRIM71Q2Q1W2 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TRIM71Q2Q1W2 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TRIM71Q2Q1W2 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TRIM71Q2Q1W2 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TRIM71Q2Q1W2 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TRIM71Q2Q1W2 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TRIM71Q2Q1W2 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
TRIM71Q2Q1W2 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TRIM71Q2Q1W2 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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