Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

Predictions only

Length 750 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.6 ms