Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
RTL8BQ17RB0 Z99497.2-201ENST00000603634 310 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
RTL8BQ17RB0 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
RTL8BQ17RB0 AP000484.1-201ENST00000620067 1252 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
RTL8BQ17RB0 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC0.09□□□□□ -2.4
RTL8BQ17RB0 AC091948.2-201ENST00000636510 279 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
RTL8BQ17RB0 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
RTL8BQ17RB0 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
RTL8BQ17RB0 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
RTL8BQ17RB0 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC0.09□□□□□ -2.4
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RTL8BQ17RB0 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
RTL8BQ17RB0 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
RTL8BQ17RB0 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
RTL8BQ17RB0 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
RTL8BQ17RB0 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
RTL8BQ17RB0 LANCL1-AS1-202ENST00000420418 476 ntTSL 3 BASIC0.08□□□□□ -2.4
RTL8BQ17RB0 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC0.08□□□□□ -2.4
RTL8BQ17RB0 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
RTL8BQ17RB0 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
RTL8BQ17RB0 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC0.08□□□□□ -2.4
RTL8BQ17RB0 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
RTL8BQ17RB0 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
RTL8BQ17RB0 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
RTL8BQ17RB0 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
RTL8BQ17RB0 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
RTL8BQ17RB0 XIRP2-AS1-201ENST00000525330 776 ntTSL 3 BASIC0.08□□□□□ -2.4
RTL8BQ17RB0 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC0.08□□□□□ -2.4
RTL8BQ17RB0 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
RTL8BQ17RB0 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
RTL8BQ17RB0 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
RTL8BQ17RB0 AL670729.3-201ENST00000602345 574 ntTSL 4 BASIC0.08□□□□□ -2.4
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RTL8BQ17RB0 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
RTL8BQ17RB0 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.07□□□□□ -2.4
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RTL8BQ17RB0 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
RTL8BQ17RB0 SNORD116-12-201ENST00000384468 92 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
RTL8BQ17RB0 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
RTL8BQ17RB0 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC0.07□□□□□ -2.4
RTL8BQ17RB0 AC090960.1-201ENST00000421072 306 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
RTL8BQ17RB0 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
RTL8BQ17RB0 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
RTL8BQ17RB0 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC0.07□□□□□ -2.4
RTL8BQ17RB0 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
RTL8BQ17RB0 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
RTL8BQ17RB0 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
RTL8BQ17RB0 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
RTL8BQ17RB0 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC0.07□□□□□ -2.4
RTL8BQ17RB0 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
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RTL8BQ17RB0 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
RTL8BQ17RB0 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
RTL8BQ17RB0 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC0.06□□□□□ -2.4
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RTL8BQ17RB0 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC0.05□□□□□ -2.4
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RTL8BQ17RB0 AC069114.1-201ENST00000580927 287 ntTSL 2 BASIC0.05□□□□□ -2.4
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RTL8BQ17RB0 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
RTL8BQ17RB0 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
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