Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ME3Q16798 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ME3Q16798 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ME3Q16798 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
ME3Q16798 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ME3Q16798 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
ME3Q16798 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
ME3Q16798 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ME3Q16798 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ME3Q16798 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ME3Q16798 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ME3Q16798 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ME3Q16798 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ME3Q16798 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ME3Q16798 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
ME3Q16798 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ME3Q16798 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ME3Q16798 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ME3Q16798 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ME3Q16798 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ME3Q16798 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
ME3Q16798 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
ME3Q16798 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ME3Q16798 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ME3Q16798 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ME3Q16798 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ME3Q16798 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC2.43□□□□□ -2.02
ME3Q16798 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ME3Q16798 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ME3Q16798 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ME3Q16798 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ME3Q16798 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ME3Q16798 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ME3Q16798 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
ME3Q16798 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ME3Q16798 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ME3Q16798 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ME3Q16798 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ME3Q16798 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ME3Q16798 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ME3Q16798 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ME3Q16798 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ME3Q16798 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ME3Q16798 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ME3Q16798 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ME3Q16798 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ME3Q16798 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ME3Q16798 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ME3Q16798 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ME3Q16798 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
ME3Q16798 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
ME3Q16798 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ME3Q16798 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ME3Q16798 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ME3Q16798 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ME3Q16798 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ME3Q16798 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ME3Q16798 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ME3Q16798 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ME3Q16798 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ME3Q16798 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ME3Q16798 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ME3Q16798 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ME3Q16798 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ME3Q16798 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
ME3Q16798 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ME3Q16798 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
ME3Q16798 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ME3Q16798 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ME3Q16798 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ME3Q16798 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ME3Q16798 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
ME3Q16798 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ME3Q16798 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
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ME3Q16798 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ME3Q16798 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ME3Q16798 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ME3Q16798 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ME3Q16798 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ME3Q16798 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ME3Q16798 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ME3Q16798 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ME3Q16798 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ME3Q16798 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ME3Q16798 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
ME3Q16798 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
ME3Q16798 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ME3Q16798 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ME3Q16798 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ME3Q16798 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ME3Q16798 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ME3Q16798 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ME3Q16798 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ME3Q16798 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
ME3Q16798 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ME3Q16798 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ME3Q16798 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ME3Q16798 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ME3Q16798 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
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