Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PUM3Q15397 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PUM3Q15397 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PUM3Q15397 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PUM3Q15397 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PUM3Q15397 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PUM3Q15397 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PUM3Q15397 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PUM3Q15397 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
PUM3Q15397 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PUM3Q15397 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PUM3Q15397 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PUM3Q15397 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PUM3Q15397 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PUM3Q15397 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
PUM3Q15397 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PUM3Q15397 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PUM3Q15397 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PUM3Q15397 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PUM3Q15397 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PUM3Q15397 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PUM3Q15397 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PUM3Q15397 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PUM3Q15397 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PUM3Q15397 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PUM3Q15397 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
PUM3Q15397 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PUM3Q15397 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PUM3Q15397 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
PUM3Q15397 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
PUM3Q15397 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
PUM3Q15397 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PUM3Q15397 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
PUM3Q15397 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PUM3Q15397 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
PUM3Q15397 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PUM3Q15397 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PUM3Q15397 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PUM3Q15397 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
PUM3Q15397 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
PUM3Q15397 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
PUM3Q15397 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PUM3Q15397 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PUM3Q15397 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PUM3Q15397 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PUM3Q15397 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
PUM3Q15397 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PUM3Q15397 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PUM3Q15397 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PUM3Q15397 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PUM3Q15397 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PUM3Q15397 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PUM3Q15397 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
PUM3Q15397 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
PUM3Q15397 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
PUM3Q15397 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
PUM3Q15397 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PUM3Q15397 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PUM3Q15397 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PUM3Q15397 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
PUM3Q15397 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PUM3Q15397 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PUM3Q15397 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PUM3Q15397 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PUM3Q15397 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PUM3Q15397 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PUM3Q15397 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PUM3Q15397 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PUM3Q15397 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
PUM3Q15397 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
PUM3Q15397 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
PUM3Q15397 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PUM3Q15397 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PUM3Q15397 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
PUM3Q15397 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PUM3Q15397 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PUM3Q15397 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PUM3Q15397 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PUM3Q15397 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
PUM3Q15397 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC2.59□□□□□ -2
PUM3Q15397 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
PUM3Q15397 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PUM3Q15397 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PUM3Q15397 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PUM3Q15397 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
PUM3Q15397 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PUM3Q15397 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PUM3Q15397 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PUM3Q15397 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PUM3Q15397 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PUM3Q15397 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PUM3Q15397 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
PUM3Q15397 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
PUM3Q15397 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
PUM3Q15397 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PUM3Q15397 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PUM3Q15397 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PUM3Q15397 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PUM3Q15397 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PUM3Q15397 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.3 ms