Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RABEP1Q15276 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RABEP1Q15276 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RABEP1Q15276 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RABEP1Q15276 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RABEP1Q15276 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RABEP1Q15276 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RABEP1Q15276 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RABEP1Q15276 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RABEP1Q15276 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RABEP1Q15276 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RABEP1Q15276 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RABEP1Q15276 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RABEP1Q15276 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RABEP1Q15276 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RABEP1Q15276 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RABEP1Q15276 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RABEP1Q15276 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RABEP1Q15276 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RABEP1Q15276 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RABEP1Q15276 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RABEP1Q15276 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RABEP1Q15276 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RABEP1Q15276 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RABEP1Q15276 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RABEP1Q15276 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
RABEP1Q15276 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RABEP1Q15276 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
RABEP1Q15276 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RABEP1Q15276 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RABEP1Q15276 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RABEP1Q15276 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RABEP1Q15276 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RABEP1Q15276 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RABEP1Q15276 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RABEP1Q15276 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RABEP1Q15276 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RABEP1Q15276 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RABEP1Q15276 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RABEP1Q15276 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RABEP1Q15276 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RABEP1Q15276 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RABEP1Q15276 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RABEP1Q15276 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RABEP1Q15276 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RABEP1Q15276 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RABEP1Q15276 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
RABEP1Q15276 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RABEP1Q15276 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RABEP1Q15276 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RABEP1Q15276 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RABEP1Q15276 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
RABEP1Q15276 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RABEP1Q15276 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RABEP1Q15276 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RABEP1Q15276 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RABEP1Q15276 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RABEP1Q15276 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RABEP1Q15276 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RABEP1Q15276 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RABEP1Q15276 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RABEP1Q15276 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RABEP1Q15276 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RABEP1Q15276 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RABEP1Q15276 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RABEP1Q15276 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RABEP1Q15276 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RABEP1Q15276 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RABEP1Q15276 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RABEP1Q15276 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RABEP1Q15276 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RABEP1Q15276 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RABEP1Q15276 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RABEP1Q15276 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RABEP1Q15276 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RABEP1Q15276 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RABEP1Q15276 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RABEP1Q15276 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RABEP1Q15276 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RABEP1Q15276 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
RABEP1Q15276 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
RABEP1Q15276 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RABEP1Q15276 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RABEP1Q15276 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RABEP1Q15276 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RABEP1Q15276 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RABEP1Q15276 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RABEP1Q15276 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RABEP1Q15276 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RABEP1Q15276 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RABEP1Q15276 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RABEP1Q15276 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RABEP1Q15276 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RABEP1Q15276 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RABEP1Q15276 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RABEP1Q15276 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RABEP1Q15276 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RABEP1Q15276 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RABEP1Q15276 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RABEP1Q15276 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 171.3 ms