Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC3.06□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.1 ms