Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC2.47□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.9 ms