Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SHPRHQ149N8 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SHPRHQ149N8 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC-0.55□□□□□ -2.5
SHPRHQ149N8 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SHPRHQ149N8 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC-0.55□□□□□ -2.5
SHPRHQ149N8 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SHPRHQ149N8 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC-0.55□□□□□ -2.5
SHPRHQ149N8 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SHPRHQ149N8 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SHPRHQ149N8 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SHPRHQ149N8 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SHPRHQ149N8 AC138915.2-201ENST00000569776 97 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SHPRHQ149N8 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SHPRHQ149N8 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SHPRHQ149N8 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SHPRHQ149N8 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SHPRHQ149N8 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SHPRHQ149N8 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
SHPRHQ149N8 MTND4P24-201ENST00000424002 397 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SHPRHQ149N8 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
SHPRHQ149N8 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SHPRHQ149N8 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
SHPRHQ149N8 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SHPRHQ149N8 MIR198-201ENST00000637333 62 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SHPRHQ149N8 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SHPRHQ149N8 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SHPRHQ149N8 HIGD1AP15-201ENST00000416198 280 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SHPRHQ149N8 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
SHPRHQ149N8 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
SHPRHQ149N8 AL133217.1-201ENST00000450980 425 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SHPRHQ149N8 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SHPRHQ149N8 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SHPRHQ149N8 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
SHPRHQ149N8 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SHPRHQ149N8 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
SHPRHQ149N8 PART1_2.1-201ENST00000612397 250 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SHPRHQ149N8 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SHPRHQ149N8 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SHPRHQ149N8 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SHPRHQ149N8 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC-0.57□□□□□ -2.5
SHPRHQ149N8 RNU6ATAC22P-201ENST00000516794 89 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SHPRHQ149N8 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SHPRHQ149N8 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SHPRHQ149N8 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SHPRHQ149N8 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SHPRHQ149N8 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SHPRHQ149N8 AC253576.2-201ENST00000618815 580 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SHPRHQ149N8 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SHPRHQ149N8 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC-0.57□□□□□ -2.5
SHPRHQ149N8 AC092813.1-201ENST00000635455 969 ntTSL 5 BASIC-0.57□□□□□ -2.5
SHPRHQ149N8 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SHPRHQ149N8 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SHPRHQ149N8 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SHPRHQ149N8 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SHPRHQ149N8 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
SHPRHQ149N8 LINC02358-201ENST00000514413 465 ntTSL 5 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
SHPRHQ149N8 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SHPRHQ149N8 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SHPRHQ149N8 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SHPRHQ149N8 MIR548AZ-201ENST00000616567 95 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SHPRHQ149N8 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SHPRHQ149N8 AC006927.4-201ENST00000639187 543 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SHPRHQ149N8 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SHPRHQ149N8 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SHPRHQ149N8 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
SHPRHQ149N8 AC011891.1-201ENST00000437088 432 ntTSL 3 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
SHPRHQ149N8 AL513412.1-201ENST00000445708 553 ntTSL 4 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
SHPRHQ149N8 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
SHPRHQ149N8 AC113347.3-201ENST00000509113 148 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SHPRHQ149N8 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SHPRHQ149N8 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SHPRHQ149N8 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SHPRHQ149N8 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
SHPRHQ149N8 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SHPRHQ149N8 RNU6-796P-201ENST00000391086 107 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SHPRHQ149N8 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SHPRHQ149N8 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
SHPRHQ149N8 MTCO3P43-201ENST00000440974 771 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SHPRHQ149N8 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SHPRHQ149N8 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SHPRHQ149N8 AC018554.1-201ENST00000565506 800 ntTSL 2 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
SHPRHQ149N8 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
SHPRHQ149N8 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SHPRHQ149N8 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SHPRHQ149N8 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SHPRHQ149N8 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SHPRHQ149N8 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.6□□□□□ -2.51
SHPRHQ149N8 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SHPRHQ149N8 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SHPRHQ149N8 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SHPRHQ149N8 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SHPRHQ149N8 RNU6-575P-201ENST00000411326 105 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SHPRHQ149N8 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC-0.6□□□□□ -2.51
SHPRHQ149N8 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC-0.6□□□□□ -2.51
SHPRHQ149N8 RNU7-159P-201ENST00000459284 62 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SHPRHQ149N8 AP001189.2-201ENST00000527320 189 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SHPRHQ149N8 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC-0.6□□□□□ -2.51
SHPRHQ149N8 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SHPRHQ149N8 TMF1P1-201ENST00000576058 373 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SHPRHQ149N8 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
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