Protein–RNA interactions for Protein: Q14684

RRP1B, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1BQ14684 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC3.19□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC3.18□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC3.17□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107 ms