Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
SCARB2Q14108 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SCARB2Q14108 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SCARB2Q14108 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SCARB2Q14108 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SCARB2Q14108 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SCARB2Q14108 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SCARB2Q14108 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SCARB2Q14108 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SCARB2Q14108 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SCARB2Q14108 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SCARB2Q14108 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SCARB2Q14108 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SCARB2Q14108 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SCARB2Q14108 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SCARB2Q14108 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SCARB2Q14108 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SCARB2Q14108 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SCARB2Q14108 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SCARB2Q14108 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SCARB2Q14108 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SCARB2Q14108 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SCARB2Q14108 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
SCARB2Q14108 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SCARB2Q14108 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SCARB2Q14108 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SCARB2Q14108 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SCARB2Q14108 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SCARB2Q14108 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SCARB2Q14108 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SCARB2Q14108 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SCARB2Q14108 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SCARB2Q14108 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
SCARB2Q14108 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SCARB2Q14108 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SCARB2Q14108 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SCARB2Q14108 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SCARB2Q14108 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
SCARB2Q14108 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
SCARB2Q14108 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SCARB2Q14108 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SCARB2Q14108 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SCARB2Q14108 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SCARB2Q14108 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SCARB2Q14108 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SCARB2Q14108 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SCARB2Q14108 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SCARB2Q14108 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SCARB2Q14108 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SCARB2Q14108 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SCARB2Q14108 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SCARB2Q14108 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SCARB2Q14108 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SCARB2Q14108 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SCARB2Q14108 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SCARB2Q14108 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SCARB2Q14108 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SCARB2Q14108 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SCARB2Q14108 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SCARB2Q14108 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
SCARB2Q14108 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SCARB2Q14108 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SCARB2Q14108 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SCARB2Q14108 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SCARB2Q14108 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SCARB2Q14108 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
SCARB2Q14108 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SCARB2Q14108 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SCARB2Q14108 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SCARB2Q14108 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SCARB2Q14108 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SCARB2Q14108 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SCARB2Q14108 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SCARB2Q14108 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SCARB2Q14108 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SCARB2Q14108 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SCARB2Q14108 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SCARB2Q14108 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SCARB2Q14108 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SCARB2Q14108 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SCARB2Q14108 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SCARB2Q14108 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SCARB2Q14108 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SCARB2Q14108 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SCARB2Q14108 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SCARB2Q14108 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SCARB2Q14108 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SCARB2Q14108 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SCARB2Q14108 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SCARB2Q14108 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SCARB2Q14108 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SCARB2Q14108 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SCARB2Q14108 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SCARB2Q14108 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SCARB2Q14108 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SCARB2Q14108 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SCARB2Q14108 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SCARB2Q14108 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SCARB2Q14108 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SCARB2Q14108 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
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