Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
CUL4BQ13620 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CUL4BQ13620 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CUL4BQ13620 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CUL4BQ13620 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CUL4BQ13620 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CUL4BQ13620 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CUL4BQ13620 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CUL4BQ13620 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CUL4BQ13620 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CUL4BQ13620 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CUL4BQ13620 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CUL4BQ13620 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CUL4BQ13620 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CUL4BQ13620 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
CUL4BQ13620 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CUL4BQ13620 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CUL4BQ13620 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CUL4BQ13620 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CUL4BQ13620 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CUL4BQ13620 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CUL4BQ13620 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CUL4BQ13620 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CUL4BQ13620 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CUL4BQ13620 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CUL4BQ13620 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CUL4BQ13620 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CUL4BQ13620 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CUL4BQ13620 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CUL4BQ13620 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CUL4BQ13620 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CUL4BQ13620 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CUL4BQ13620 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CUL4BQ13620 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CUL4BQ13620 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CUL4BQ13620 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CUL4BQ13620 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CUL4BQ13620 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CUL4BQ13620 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CUL4BQ13620 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CUL4BQ13620 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CUL4BQ13620 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CUL4BQ13620 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CUL4BQ13620 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CUL4BQ13620 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CUL4BQ13620 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CUL4BQ13620 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CUL4BQ13620 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CUL4BQ13620 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CUL4BQ13620 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CUL4BQ13620 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CUL4BQ13620 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CUL4BQ13620 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CUL4BQ13620 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CUL4BQ13620 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CUL4BQ13620 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CUL4BQ13620 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CUL4BQ13620 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CUL4BQ13620 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CUL4BQ13620 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.9 ms