Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC0.22□□□□□ -2.37
KRR1Q13601 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
KRR1Q13601 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC0.22□□□□□ -2.37
KRR1Q13601 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
KRR1Q13601 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC0.22□□□□□ -2.37
KRR1Q13601 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
KRR1Q13601 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
KRR1Q13601 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
KRR1Q13601 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
KRR1Q13601 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
KRR1Q13601 AL445984.1-201ENST00000637834 659 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
KRR1Q13601 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC0.22□□□□□ -2.37
KRR1Q13601 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
KRR1Q13601 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
KRR1Q13601 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
KRR1Q13601 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
KRR1Q13601 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
KRR1Q13601 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
KRR1Q13601 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
KRR1Q13601 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC0.21□□□□□ -2.38
KRR1Q13601 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC0.21□□□□□ -2.38
KRR1Q13601 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.21□□□□□ -2.38
KRR1Q13601 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC0.21□□□□□ -2.38
KRR1Q13601 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
KRR1Q13601 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
KRR1Q13601 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
KRR1Q13601 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
KRR1Q13601 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
KRR1Q13601 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
KRR1Q13601 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC0.21□□□□□ -2.38
KRR1Q13601 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
KRR1Q13601 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
KRR1Q13601 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
KRR1Q13601 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
KRR1Q13601 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
KRR1Q13601 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
KRR1Q13601 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
KRR1Q13601 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
KRR1Q13601 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
KRR1Q13601 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
KRR1Q13601 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC0.2□□□□□ -2.38
KRR1Q13601 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
KRR1Q13601 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC0.2□□□□□ -2.38
KRR1Q13601 LINC01674-201ENST00000427446 504 ntTSL 3 BASIC0.2□□□□□ -2.38
KRR1Q13601 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
KRR1Q13601 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
KRR1Q13601 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
KRR1Q13601 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
KRR1Q13601 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
KRR1Q13601 AC016550.1-201ENST00000505348 785 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
KRR1Q13601 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC0.2□□□□□ -2.38
KRR1Q13601 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
KRR1Q13601 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
KRR1Q13601 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC0.2□□□□□ -2.38
KRR1Q13601 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
KRR1Q13601 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
KRR1Q13601 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
KRR1Q13601 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
KRR1Q13601 RNU5E-10P-201ENST00000363506 118 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
KRR1Q13601 RNU4-92P-201ENST00000363783 136 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
KRR1Q13601 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
KRR1Q13601 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
KRR1Q13601 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
KRR1Q13601 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
KRR1Q13601 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
KRR1Q13601 ANKRD10-IT1-201ENST00000426991 800 ntTSL 2 BASIC0.19□□□□□ -2.38
KRR1Q13601 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC0.19□□□□□ -2.38
KRR1Q13601 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
KRR1Q13601 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
KRR1Q13601 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
KRR1Q13601 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC0.19□□□□□ -2.38
KRR1Q13601 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
KRR1Q13601 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
KRR1Q13601 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
KRR1Q13601 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
KRR1Q13601 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
KRR1Q13601 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
KRR1Q13601 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
KRR1Q13601 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
KRR1Q13601 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
KRR1Q13601 AL355314.1-201ENST00000453639 316 ntTSL 5 BASIC0.18□□□□□ -2.38
KRR1Q13601 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
KRR1Q13601 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
KRR1Q13601 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
KRR1Q13601 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
KRR1Q13601 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
KRR1Q13601 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
KRR1Q13601 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC0.18□□□□□ -2.38
KRR1Q13601 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
KRR1Q13601 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
KRR1Q13601 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
KRR1Q13601 AL078595.3-201ENST00000623815 1166 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
KRR1Q13601 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC0.18□□□□□ -2.38
KRR1Q13601 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC0.18□□□□□ -2.38
KRR1Q13601 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.17□□□□□ -2.38
KRR1Q13601 AP000568.1-201ENST00000282964 442 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
KRR1Q13601 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
KRR1Q13601 RNU4-68P-201ENST00000364314 141 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
KRR1Q13601 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
KRR1Q13601 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
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