Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
ATRQ13535 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
ATRQ13535 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
ATRQ13535 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
ATRQ13535 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
ATRQ13535 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
ATRQ13535 AC108733.1-201ENST00000479244 705 ntTSL 3 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
ATRQ13535 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
ATRQ13535 RNY4-201ENST00000516507 96 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
ATRQ13535 RNU6-1247P-201ENST00000516622 98 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
ATRQ13535 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
ATRQ13535 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
ATRQ13535 AC069114.1-201ENST00000580927 287 ntTSL 2 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
ATRQ13535 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
ATRQ13535 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
ATRQ13535 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC-0.24□□□□□ -2.45
ATRQ13535 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
ATRQ13535 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
ATRQ13535 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
ATRQ13535 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
ATRQ13535 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
ATRQ13535 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
ATRQ13535 UBE2D3P3-201ENST00000426992 425 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
ATRQ13535 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
ATRQ13535 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
ATRQ13535 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
ATRQ13535 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
ATRQ13535 AC112206.4-201ENST00000515142 405 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
ATRQ13535 Y_RNA.696-201ENST00000516725 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
ATRQ13535 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
ATRQ13535 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
ATRQ13535 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
ATRQ13535 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
ATRQ13535 SNORA18.1-201ENST00000363418 128 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
ATRQ13535 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
ATRQ13535 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
ATRQ13535 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
ATRQ13535 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
ATRQ13535 MIR145-201ENST00000384967 88 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
ATRQ13535 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
ATRQ13535 RNU4-22P-201ENST00000411058 166 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
ATRQ13535 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
ATRQ13535 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
ATRQ13535 AC092958.2-201ENST00000476987 492 ntTSL 3 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
ATRQ13535 MTCO1P31-201ENST00000506355 492 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
ATRQ13535 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
ATRQ13535 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
ATRQ13535 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
ATRQ13535 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
ATRQ13535 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
ATRQ13535 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
ATRQ13535 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
ATRQ13535 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
ATRQ13535 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
ATRQ13535 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
ATRQ13535 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
ATRQ13535 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
ATRQ13535 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
ATRQ13535 Z99497.2-201ENST00000603634 310 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
ATRQ13535 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
ATRQ13535 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
ATRQ13535 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
ATRQ13535 MIR1246-201ENST00000636535 73 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
ATRQ13535 SNORD14C-201ENST00000365382 88 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
ATRQ13535 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
ATRQ13535 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
ATRQ13535 MIR892B-201ENST00000401279 77 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
ATRQ13535 DPRXP1-201ENST00000426312 460 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
ATRQ13535 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
ATRQ13535 AC002542.1-201ENST00000440683 193 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
ATRQ13535 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
ATRQ13535 AC113347.4-201ENST00000506032 685 ntTSL 3 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
ATRQ13535 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
ATRQ13535 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
ATRQ13535 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
ATRQ13535 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
ATRQ13535 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
ATRQ13535 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
ATRQ13535 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC-0.26□□□□□ -2.45
ATRQ13535 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ATRQ13535 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ATRQ13535 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ATRQ13535 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ATRQ13535 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ATRQ13535 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
ATRQ13535 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ATRQ13535 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ATRQ13535 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ATRQ13535 RNU6ATAC22P-201ENST00000516794 89 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ATRQ13535 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ATRQ13535 LRRC34P1-201ENST00000542742 915 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ATRQ13535 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ATRQ13535 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ATRQ13535 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ATRQ13535 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ATRQ13535 AC083799.1-201ENST00000366451 910 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ATRQ13535 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ATRQ13535 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ATRQ13535 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ATRQ13535 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
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