Protein–RNA interactions for Protein: Q13439

GOLGA4, Golgin subfamily A member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA4Q13439 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
GOLGA4Q13439 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC-0.34□□□□□ -2.46
GOLGA4Q13439 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
GOLGA4Q13439 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
GOLGA4Q13439 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
GOLGA4Q13439 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
GOLGA4Q13439 AL606834.3-201ENST00000602615 496 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
GOLGA4Q13439 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
GOLGA4Q13439 MIR1264-201ENST00000616374 69 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
GOLGA4Q13439 AC093875.1-201ENST00000623688 504 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
GOLGA4Q13439 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
GOLGA4Q13439 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
GOLGA4Q13439 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
GOLGA4Q13439 RNA5SP266-201ENST00000410273 108 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
GOLGA4Q13439 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
GOLGA4Q13439 AC091212.1-201ENST00000474798 395 ntTSL 5 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
GOLGA4Q13439 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
GOLGA4Q13439 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
GOLGA4Q13439 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
GOLGA4Q13439 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
GOLGA4Q13439 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
GOLGA4Q13439 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
GOLGA4Q13439 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
GOLGA4Q13439 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
GOLGA4Q13439 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
GOLGA4Q13439 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
GOLGA4Q13439 MTCO3P43-201ENST00000440974 771 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
GOLGA4Q13439 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
GOLGA4Q13439 AC079917.1-202ENST00000534059 625 ntTSL 3 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
GOLGA4Q13439 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
GOLGA4Q13439 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
GOLGA4Q13439 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
GOLGA4Q13439 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
GOLGA4Q13439 SNORD14C-201ENST00000365382 88 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
GOLGA4Q13439 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
GOLGA4Q13439 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
GOLGA4Q13439 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
GOLGA4Q13439 ZFAND6P1-201ENST00000434138 605 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
GOLGA4Q13439 AC007000.2-201ENST00000442564 487 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
GOLGA4Q13439 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
GOLGA4Q13439 AC010486.2-201ENST00000505572 483 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
GOLGA4Q13439 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
GOLGA4Q13439 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
GOLGA4Q13439 AL354696.1-201ENST00000614652 497 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
GOLGA4Q13439 MIR1295B-201ENST00000636144 60 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
GOLGA4Q13439 AC099654.8-201ENST00000637757 681 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
GOLGA4Q13439 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
GOLGA4Q13439 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.36□□□□□ -2.47
GOLGA4Q13439 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
GOLGA4Q13439 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
GOLGA4Q13439 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
GOLGA4Q13439 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
GOLGA4Q13439 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
GOLGA4Q13439 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
GOLGA4Q13439 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
GOLGA4Q13439 AC026414.1-201ENST00000504046 698 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
GOLGA4Q13439 AC023632.1-201ENST00000518463 375 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
GOLGA4Q13439 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
GOLGA4Q13439 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
GOLGA4Q13439 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
GOLGA4Q13439 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
GOLGA4Q13439 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
GOLGA4Q13439 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
GOLGA4Q13439 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
GOLGA4Q13439 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
GOLGA4Q13439 MIR145-201ENST00000384967 88 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
GOLGA4Q13439 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
GOLGA4Q13439 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
GOLGA4Q13439 MTND1P20-201ENST00000430341 950 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
GOLGA4Q13439 SNORD4A-201ENST00000459174 72 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
GOLGA4Q13439 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
GOLGA4Q13439 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
GOLGA4Q13439 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
GOLGA4Q13439 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
GOLGA4Q13439 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
GOLGA4Q13439 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
GOLGA4Q13439 MIR548H2-201ENST00000408874 88 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
GOLGA4Q13439 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
GOLGA4Q13439 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
GOLGA4Q13439 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
GOLGA4Q13439 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
GOLGA4Q13439 AL513412.1-201ENST00000445708 553 ntTSL 4 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
GOLGA4Q13439 AL133217.1-201ENST00000450980 425 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
GOLGA4Q13439 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
GOLGA4Q13439 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
GOLGA4Q13439 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
GOLGA4Q13439 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
GOLGA4Q13439 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
GOLGA4Q13439 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
GOLGA4Q13439 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
GOLGA4Q13439 RNU6-1122P-201ENST00000384449 107 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
GOLGA4Q13439 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
GOLGA4Q13439 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
GOLGA4Q13439 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
GOLGA4Q13439 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
GOLGA4Q13439 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
GOLGA4Q13439 AHI1-208ENST00000488690 712 ntTSL 5 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
GOLGA4Q13439 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
GOLGA4Q13439 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
GOLGA4Q13439 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.9 ms