Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
MKRN4PQ13434 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
MKRN4PQ13434 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
MKRN4PQ13434 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
MKRN4PQ13434 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
MKRN4PQ13434 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
MKRN4PQ13434 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
MKRN4PQ13434 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
MKRN4PQ13434 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
MKRN4PQ13434 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
MKRN4PQ13434 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
MKRN4PQ13434 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
MKRN4PQ13434 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
MKRN4PQ13434 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
MKRN4PQ13434 AL592156.1-201ENST00000508758 304 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
MKRN4PQ13434 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
MKRN4PQ13434 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
MKRN4PQ13434 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
MKRN4PQ13434 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
MKRN4PQ13434 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
MKRN4PQ13434 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
MKRN4PQ13434 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
MKRN4PQ13434 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
MKRN4PQ13434 AL033397.1-201ENST00000502390 3653 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
MKRN4PQ13434 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
MKRN4PQ13434 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
MKRN4PQ13434 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
MKRN4PQ13434 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
MKRN4PQ13434 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
MKRN4PQ13434 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
MKRN4PQ13434 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
MKRN4PQ13434 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
MKRN4PQ13434 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
MKRN4PQ13434 ZEB2-241ENST00000637304 9158 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
MKRN4PQ13434 FYB1-201ENST00000351578 4750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
MKRN4PQ13434 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
MKRN4PQ13434 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
MKRN4PQ13434 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
MKRN4PQ13434 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
MKRN4PQ13434 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
MKRN4PQ13434 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
MKRN4PQ13434 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
MKRN4PQ13434 HEATR5A-203ENST00000543095 7840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
MKRN4PQ13434 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
MKRN4PQ13434 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
MKRN4PQ13434 AL645608.4-201ENST00000423619 154 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
MKRN4PQ13434 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
MKRN4PQ13434 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
MKRN4PQ13434 SCARNA22-201ENST00000503991 125 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
MKRN4PQ13434 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
MKRN4PQ13434 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
MKRN4PQ13434 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
MKRN4PQ13434 IGHV4OR15-8-201ENST00000557788 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
MKRN4PQ13434 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
MKRN4PQ13434 AC135068.2-201ENST00000622410 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
MKRN4PQ13434 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
MKRN4PQ13434 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
MKRN4PQ13434 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
MKRN4PQ13434 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
MKRN4PQ13434 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
MKRN4PQ13434 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
MKRN4PQ13434 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
MKRN4PQ13434 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
MKRN4PQ13434 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
MKRN4PQ13434 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
MKRN4PQ13434 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
MKRN4PQ13434 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
MKRN4PQ13434 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
MKRN4PQ13434 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
MKRN4PQ13434 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
MKRN4PQ13434 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
MKRN4PQ13434 AC129510.2-201ENST00000582774 345 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
MKRN4PQ13434 MAPK10-349ENST00000641767 3661 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
MKRN4PQ13434 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
MKRN4PQ13434 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
MKRN4PQ13434 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
MKRN4PQ13434 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
MKRN4PQ13434 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
MKRN4PQ13434 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
MKRN4PQ13434 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
MKRN4PQ13434 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
MKRN4PQ13434 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
MKRN4PQ13434 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
MKRN4PQ13434 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
MKRN4PQ13434 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
MKRN4PQ13434 AC134698.5-201ENST00000519444 336 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
MKRN4PQ13434 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
MKRN4PQ13434 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
MKRN4PQ13434 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
MKRN4PQ13434 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
MKRN4PQ13434 EFHC1-205ENST00000538167 5308 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
MKRN4PQ13434 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
MKRN4PQ13434 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
MKRN4PQ13434 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
MKRN4PQ13434 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
MKRN4PQ13434 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
MKRN4PQ13434 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
MKRN4PQ13434 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
MKRN4PQ13434 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
MKRN4PQ13434 AL033380.1-201ENST00000442781 421 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
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