Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ERCC8Q13216 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ERCC8Q13216 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ERCC8Q13216 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ERCC8Q13216 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ERCC8Q13216 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ERCC8Q13216 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ERCC8Q13216 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ERCC8Q13216 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ERCC8Q13216 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ERCC8Q13216 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
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ERCC8Q13216 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ERCC8Q13216 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC1.2□□□□□ -2.22
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ERCC8Q13216 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ERCC8Q13216 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ERCC8Q13216 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ERCC8Q13216 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC1.2□□□□□ -2.22
ERCC8Q13216 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
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ERCC8Q13216 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ERCC8Q13216 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ERCC8Q13216 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ERCC8Q13216 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ERCC8Q13216 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ERCC8Q13216 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ERCC8Q13216 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.19□□□□□ -2.22
ERCC8Q13216 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.19□□□□□ -2.22
ERCC8Q13216 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.19□□□□□ -2.22
ERCC8Q13216 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ERCC8Q13216 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
ERCC8Q13216 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ERCC8Q13216 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
ERCC8Q13216 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ERCC8Q13216 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
ERCC8Q13216 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
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ERCC8Q13216 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
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ERCC8Q13216 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ERCC8Q13216 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
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ERCC8Q13216 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
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ERCC8Q13216 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ERCC8Q13216 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ERCC8Q13216 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ERCC8Q13216 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ERCC8Q13216 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
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ERCC8Q13216 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ERCC8Q13216 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ERCC8Q13216 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
ERCC8Q13216 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ERCC8Q13216 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ERCC8Q13216 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
ERCC8Q13216 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
ERCC8Q13216 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
ERCC8Q13216 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ERCC8Q13216 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ERCC8Q13216 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ERCC8Q13216 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ERCC8Q13216 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ERCC8Q13216 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ERCC8Q13216 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC1.17□□□□□ -2.22
ERCC8Q13216 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
ERCC8Q13216 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ERCC8Q13216 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC1.17□□□□□ -2.22
ERCC8Q13216 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ERCC8Q13216 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
ERCC8Q13216 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ERCC8Q13216 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ERCC8Q13216 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
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