Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
RESTQ13127 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RESTQ13127 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RESTQ13127 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
RESTQ13127 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
RESTQ13127 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
RESTQ13127 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RESTQ13127 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RESTQ13127 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RESTQ13127 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RESTQ13127 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RESTQ13127 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RESTQ13127 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RESTQ13127 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
RESTQ13127 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RESTQ13127 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RESTQ13127 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RESTQ13127 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RESTQ13127 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RESTQ13127 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RESTQ13127 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RESTQ13127 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RESTQ13127 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RESTQ13127 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RESTQ13127 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RESTQ13127 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RESTQ13127 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RESTQ13127 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RESTQ13127 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RESTQ13127 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RESTQ13127 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
RESTQ13127 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RESTQ13127 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
RESTQ13127 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
RESTQ13127 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
RESTQ13127 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
RESTQ13127 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
RESTQ13127 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
RESTQ13127 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
RESTQ13127 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
RESTQ13127 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
RESTQ13127 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
RESTQ13127 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
RESTQ13127 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
RESTQ13127 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
RESTQ13127 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
RESTQ13127 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
RESTQ13127 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
RESTQ13127 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
RESTQ13127 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
RESTQ13127 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
RESTQ13127 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
RESTQ13127 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
RESTQ13127 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
RESTQ13127 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
RESTQ13127 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
RESTQ13127 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
RESTQ13127 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
RESTQ13127 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
RESTQ13127 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
RESTQ13127 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
RESTQ13127 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
RESTQ13127 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
RESTQ13127 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
RESTQ13127 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
RESTQ13127 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
RESTQ13127 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC3.01□□□□□ -1.93
RESTQ13127 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
RESTQ13127 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
RESTQ13127 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
RESTQ13127 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
RESTQ13127 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
RESTQ13127 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
RESTQ13127 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
RESTQ13127 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
RESTQ13127 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
RESTQ13127 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
RESTQ13127 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RESTQ13127 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RESTQ13127 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RESTQ13127 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
RESTQ13127 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RESTQ13127 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RESTQ13127 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
RESTQ13127 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RESTQ13127 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RESTQ13127 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RESTQ13127 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RESTQ13127 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RESTQ13127 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
RESTQ13127 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RESTQ13127 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
RESTQ13127 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
RESTQ13127 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RESTQ13127 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
RESTQ13127 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RESTQ13127 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
RESTQ13127 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RESTQ13127 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RESTQ13127 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.5 ms