Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
MKRN3Q13064 TMCO5A-203ENST00000558158 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
MKRN3Q13064 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
MKRN3Q13064 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
MKRN3Q13064 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
MKRN3Q13064 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
MKRN3Q13064 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
MKRN3Q13064 RPL21P65-201ENST00000406094 466 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
MKRN3Q13064 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
MKRN3Q13064 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
MKRN3Q13064 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
MKRN3Q13064 AC011524.1-201ENST00000590167 240 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
MKRN3Q13064 KMO-204ENST00000366559 5261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
MKRN3Q13064 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
MKRN3Q13064 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
MKRN3Q13064 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
MKRN3Q13064 DAZ4-202ENST00000382314 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
MKRN3Q13064 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
MKRN3Q13064 CCSER2-210ENST00000543283 5888 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
MKRN3Q13064 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
MKRN3Q13064 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
MKRN3Q13064 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
MKRN3Q13064 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
MKRN3Q13064 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
MKRN3Q13064 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
MKRN3Q13064 AC026726.1-201ENST00000512859 601 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
MKRN3Q13064 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
MKRN3Q13064 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
MKRN3Q13064 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
MKRN3Q13064 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
MKRN3Q13064 AC140479.6-201ENST00000633535 357 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
MKRN3Q13064 MIR4662A-201ENST00000637499 67 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
MKRN3Q13064 ATP8B4-201ENST00000284509 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
MKRN3Q13064 ZNF510-201ENST00000223428 5154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
MKRN3Q13064 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
MKRN3Q13064 DAZ4-206ENST00000449750 3271 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
MKRN3Q13064 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
MKRN3Q13064 OR52E4-202ENST00000641726 2947 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
MKRN3Q13064 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
MKRN3Q13064 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
MKRN3Q13064 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
MKRN3Q13064 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
MKRN3Q13064 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
MKRN3Q13064 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
MKRN3Q13064 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
MKRN3Q13064 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
MKRN3Q13064 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
MKRN3Q13064 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
MKRN3Q13064 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
MKRN3Q13064 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
MKRN3Q13064 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
MKRN3Q13064 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
MKRN3Q13064 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
MKRN3Q13064 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
MKRN3Q13064 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
MKRN3Q13064 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
MKRN3Q13064 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
MKRN3Q13064 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
MKRN3Q13064 ZNF266-203ENST00000588933 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
MKRN3Q13064 MTTP-201ENST00000265517 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
MKRN3Q13064 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
MKRN3Q13064 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
MKRN3Q13064 ARHGAP42-203ENST00000524892 5685 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
MKRN3Q13064 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
MKRN3Q13064 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
MKRN3Q13064 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
MKRN3Q13064 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
MKRN3Q13064 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
MKRN3Q13064 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
MKRN3Q13064 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
MKRN3Q13064 AC005699.1-205ENST00000510639 427 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
MKRN3Q13064 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
MKRN3Q13064 RNA5SP49-201ENST00000516450 115 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
MKRN3Q13064 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
MKRN3Q13064 PCDH15-234ENST00000622048 6820 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
MKRN3Q13064 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
MKRN3Q13064 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
MKRN3Q13064 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
MKRN3Q13064 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
MKRN3Q13064 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
MKRN3Q13064 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
MKRN3Q13064 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
MKRN3Q13064 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
MKRN3Q13064 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
MKRN3Q13064 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
MKRN3Q13064 AC012671.1-201ENST00000451912 203 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
MKRN3Q13064 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
MKRN3Q13064 PPIAP15-201ENST00000479662 484 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
MKRN3Q13064 AC022655.2-201ENST00000577280 318 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
MKRN3Q13064 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
MKRN3Q13064 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
MKRN3Q13064 CPHL1P-201ENST00000461341 3407 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
MKRN3Q13064 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
MKRN3Q13064 MALRD1-204ENST00000454679 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
MKRN3Q13064 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
MKRN3Q13064 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
MKRN3Q13064 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
MKRN3Q13064 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
MKRN3Q13064 EEF1A1-211ENST00000615060 3508 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
MKRN3Q13064 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
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