Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 AP005136.1-201ENST00000579765 429 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC1.19□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC1.17□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
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