Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
BPTFQ12830 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
BPTFQ12830 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
BPTFQ12830 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
BPTFQ12830 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
BPTFQ12830 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
BPTFQ12830 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
BPTFQ12830 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
BPTFQ12830 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
BPTFQ12830 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
BPTFQ12830 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
BPTFQ12830 MTCO2P31-201ENST00000402702 684 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
BPTFQ12830 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC-0.6□□□□□ -2.51
BPTFQ12830 AP003969.1-201ENST00000531846 400 ntTSL 2 BASIC-0.6□□□□□ -2.51
BPTFQ12830 AP001981.2-201ENST00000603241 418 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
BPTFQ12830 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
BPTFQ12830 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
BPTFQ12830 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC-0.6□□□□□ -2.51
BPTFQ12830 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
BPTFQ12830 AC015724.1-201ENST00000478577 156 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
BPTFQ12830 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
BPTFQ12830 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
BPTFQ12830 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
BPTFQ12830 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
BPTFQ12830 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
BPTFQ12830 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
BPTFQ12830 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
BPTFQ12830 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
BPTFQ12830 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
BPTFQ12830 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
BPTFQ12830 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
BPTFQ12830 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
BPTFQ12830 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
BPTFQ12830 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
BPTFQ12830 AC025459.1-201ENST00000504072 156 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
BPTFQ12830 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
BPTFQ12830 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
BPTFQ12830 AC034229.4-201ENST00000607861 441 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
BPTFQ12830 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
BPTFQ12830 AL445584.3-201ENST00000617173 78 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
BPTFQ12830 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
BPTFQ12830 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
BPTFQ12830 AC004217.3-201ENST00000551552 878 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
BPTFQ12830 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
BPTFQ12830 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
BPTFQ12830 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
BPTFQ12830 AL136310.1-201ENST00000404926 654 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
BPTFQ12830 PTPRG-AS1-202ENST00000466893 823 ntTSL 4 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
BPTFQ12830 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
BPTFQ12830 AC079917.1-202ENST00000534059 625 ntTSL 3 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
BPTFQ12830 AC098483.2-201ENST00000603158 454 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
BPTFQ12830 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.62□□□□□ -2.51
BPTFQ12830 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
BPTFQ12830 CCDC58P2-201ENST00000417131 366 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
BPTFQ12830 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
BPTFQ12830 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
BPTFQ12830 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
BPTFQ12830 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
BPTFQ12830 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
BPTFQ12830 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
BPTFQ12830 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
BPTFQ12830 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
BPTFQ12830 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
BPTFQ12830 AC117525.1-201ENST00000515228 503 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
BPTFQ12830 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
BPTFQ12830 PDCD6IPP1-201ENST00000615124 579 ntTSL 2 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
BPTFQ12830 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
BPTFQ12830 AC083799.1-201ENST00000366451 910 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
BPTFQ12830 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
BPTFQ12830 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
BPTFQ12830 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
BPTFQ12830 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
BPTFQ12830 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
BPTFQ12830 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
BPTFQ12830 AC011374.2-201ENST00000607135 526 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
BPTFQ12830 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
BPTFQ12830 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
BPTFQ12830 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
BPTFQ12830 MTND4P15-201ENST00000437913 1033 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
BPTFQ12830 RPL32P14-201ENST00000463196 378 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
BPTFQ12830 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
BPTFQ12830 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
BPTFQ12830 AL139021.2-201ENST00000556390 399 ntTSL 3 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
BPTFQ12830 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
BPTFQ12830 AL590396.2-201ENST00000636511 1041 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
BPTFQ12830 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
BPTFQ12830 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
BPTFQ12830 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
BPTFQ12830 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
BPTFQ12830 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
BPTFQ12830 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
BPTFQ12830 ZNF736P1Y-201ENST00000440402 1276 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
BPTFQ12830 AL021393.1-201ENST00000456740 539 ntTSL 5 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
BPTFQ12830 USP9YP25-201ENST00000457708 443 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
BPTFQ12830 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
BPTFQ12830 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
BPTFQ12830 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
BPTFQ12830 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
BPTFQ12830 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
BPTFQ12830 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
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