Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC-1.08□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC-1.08□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 PTPRG-AS1-202ENST00000466893 823 ntTSL 4 BASIC-1.09□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 MTND5P13-201ENST00000513046 1079 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 AP001981.2-201ENST00000603241 418 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 MIR1302-8-201ENST00000408342 128 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC-1.09□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 AC073052.2-202ENST00000622296 775 ntTSL 5 BASIC-1.09□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC-1.09□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC-1.09□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 AC104985.3-201ENST00000623479 597 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
CENPEQ02224 RNU6-553P-201ENST00000364047 96 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
CENPEQ02224 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
CENPEQ02224 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
CENPEQ02224 AL603865.2-201ENST00000401679 213 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
CENPEQ02224 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
CENPEQ02224 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
CENPEQ02224 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
CENPEQ02224 NAALADL2-AS3-202ENST00000453180 413 ntTSL 3 BASIC-1.1□□□□□ -2.59
CENPEQ02224 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
CENPEQ02224 MTND4P33-201ENST00000556706 766 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
CENPEQ02224 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC-1.1□□□□□ -2.59
CENPEQ02224 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
CENPEQ02224 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC-1.1□□□□□ -2.59
CENPEQ02224 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC-1.1□□□□□ -2.59
CENPEQ02224 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
CENPEQ02224 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC-1.1□□□□□ -2.59
CENPEQ02224 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
CENPEQ02224 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
CENPEQ02224 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
CENPEQ02224 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
CENPEQ02224 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
CENPEQ02224 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
CENPEQ02224 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
CENPEQ02224 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
CENPEQ02224 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
CENPEQ02224 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
CENPEQ02224 BNIP3P23-201ENST00000599655 511 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
CENPEQ02224 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
CENPEQ02224 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
CENPEQ02224 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
CENPEQ02224 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
CENPEQ02224 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
CENPEQ02224 LINC02032-201ENST00000490465 391 ntTSL 2 BASIC-1.11□□□□□ -2.59
CENPEQ02224 AC108019.1-201ENST00000512540 175 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
CENPEQ02224 SCARNA11.2-201ENST00000517183 154 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
CENPEQ02224 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC-1.11□□□□□ -2.59
CENPEQ02224 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
CENPEQ02224 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
CENPEQ02224 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
CENPEQ02224 RNU6-83P-201ENST00000384568 112 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
CENPEQ02224 RNU6-721P-201ENST00000410155 105 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
CENPEQ02224 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
CENPEQ02224 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
CENPEQ02224 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC-1.12□□□□□ -2.59
CENPEQ02224 AC010105.1-201ENST00000437290 385 ntTSL 5 BASIC-1.12□□□□□ -2.59
CENPEQ02224 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC-1.12□□□□□ -2.59
CENPEQ02224 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
CENPEQ02224 SNORA13-201ENST00000458790 133 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
CENPEQ02224 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
CENPEQ02224 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
CENPEQ02224 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
CENPEQ02224 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
CENPEQ02224 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
CENPEQ02224 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
CENPEQ02224 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
CENPEQ02224 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC-1.12□□□□□ -2.59
CENPEQ02224 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC-1.13□□□□□ -2.59
CENPEQ02224 AL024474.2-201ENST00000431309 501 ntTSL 3 BASIC-1.13□□□□□ -2.59
CENPEQ02224 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
CENPEQ02224 ELOCP11-201ENST00000436690 332 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
CENPEQ02224 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
CENPEQ02224 ELOCP16-201ENST00000444494 332 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
CENPEQ02224 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
CENPEQ02224 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.6 ms