Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

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Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
CENPFP49454 RNU6-431P-201ENST00000383874 107 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
CENPFP49454 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
CENPFP49454 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
CENPFP49454 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
CENPFP49454 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
CENPFP49454 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
CENPFP49454 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
CENPFP49454 AC087276.4-201ENST00000530042 444 ntTSL 3 BASIC-1.46□□□□□ -2.64
CENPFP49454 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
CENPFP49454 AC104365.3-201ENST00000587011 625 ntTSL 5 BASIC-1.46□□□□□ -2.64
CENPFP49454 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
CENPFP49454 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
CENPFP49454 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
CENPFP49454 AC027031.1-201ENST00000517318 489 ntTSL 3 BASIC-1.46□□□□□ -2.64
CENPFP49454 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC-1.46□□□□□ -2.64
CENPFP49454 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
CENPFP49454 AC007527.2-201ENST00000621825 546 ntTSL 5 BASIC-1.46□□□□□ -2.64
CENPFP49454 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
CENPFP49454 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
CENPFP49454 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
CENPFP49454 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
CENPFP49454 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC-1.47□□□□□ -2.64
CENPFP49454 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
CENPFP49454 AC110792.3-201ENST00000595906 1614 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
CENPFP49454 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
CENPFP49454 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
CENPFP49454 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
CENPFP49454 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
CENPFP49454 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
CENPFP49454 RNU6-759P-201ENST00000516740 103 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
CENPFP49454 MTERF3-203ENST00000522822 1148 ntTSL 2 BASIC-1.47□□□□□ -2.64
CENPFP49454 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
CENPFP49454 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.65
CENPFP49454 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.65
CENPFP49454 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
CENPFP49454 RNU6-819P-201ENST00000364116 107 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
CENPFP49454 RNU4-7P-201ENST00000364758 141 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
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CENPFP49454 AC013476.1-201ENST00000446709 537 ntTSL 4 BASIC-1.48□□□□□ -2.65
CENPFP49454 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC-1.48□□□□□ -2.65
CENPFP49454 ZNF849P-201ENST00000594711 1566 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
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CENPFP49454 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC-1.48□□□□□ -2.65
CENPFP49454 TRBV8-1-201ENST00000481590 279 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
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CENPFP49454 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
CENPFP49454 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
CENPFP49454 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
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CENPFP49454 MIR6851-201ENST00000617060 67 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
CENPFP49454 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
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CENPFP49454 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
CENPFP49454 ULK3-223ENST00000631115 126 ntTSL 5 BASIC-1.5□□□□□ -2.65
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CENPFP49454 Y_RNA.284-201ENST00000364806 102 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
CENPFP49454 AL603865.2-201ENST00000401679 213 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
CENPFP49454 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
CENPFP49454 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
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CENPFP49454 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC-1.5□□□□□ -2.65
CENPFP49454 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.5□□□□□ -2.65
CENPFP49454 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
CENPFP49454 RNU6-576P-201ENST00000390854 102 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
CENPFP49454 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
CENPFP49454 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
CENPFP49454 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC-1.51□□□□□ -2.65
CENPFP49454 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
CENPFP49454 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC-1.51□□□□□ -2.65
CENPFP49454 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
CENPFP49454 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
CENPFP49454 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC-1.51□□□□□ -2.65
CENPFP49454 AC017104.5-201ENST00000637647 639 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
CENPFP49454 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
CENPFP49454 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC-1.51□□□□□ -2.65
CENPFP49454 AC010615.3-201ENST00000597319 394 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
CENPFP49454 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
CENPFP49454 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
CENPFP49454 SEC63P2-201ENST00000503863 1939 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
CENPFP49454 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
CENPFP49454 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
CENPFP49454 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
CENPFP49454 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
CENPFP49454 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
CENPFP49454 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC-1.52□□□□□ -2.65
CENPFP49454 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
CENPFP49454 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
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