Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.15□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC0.15□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 AC126544.2-201ENST00000625174 749 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 SNORD116.1-201ENST00000365628 92 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 AL117351.1-201ENST00000438864 766 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC0.15□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC0.15□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 AC134980.1-208ENST00000640228 535 ntTSL 5 BASIC0.15□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 ZNF736P9Y-201ENST00000439586 1345 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 AC019070.1-201ENST00000415008 1024 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 HSFY7P-201ENST00000432672 318 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 HSFY8P-201ENST00000437934 318 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 AC010486.2-201ENST00000505572 483 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC0.14□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 AL391863.2-201ENST00000411838 681 ntTSL 2 BASIC0.13□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 LINC02294-201ENST00000549330 497 ntTSL 2 BASIC0.13□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 AL139022.2-201ENST00000606934 443 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC0.13□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 PART1_2.1-201ENST00000612397 250 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC0.13□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.12□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 RNU6-413P-201ENST00000384115 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC0.12□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC0.12□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 AL049829.1-201ENST00000465411 156 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC0.12□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC0.12□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC0.12□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 MIR5190-201ENST00000581537 80 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.11□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC0.11□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC0.11□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 AC131159.1-201ENST00000621854 213 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
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