Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SNX13Q9Y5W8 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
SNX13Q9Y5W8 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SNX13Q9Y5W8 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SNX13Q9Y5W8 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SNX13Q9Y5W8 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SNX13Q9Y5W8 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SNX13Q9Y5W8 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SNX13Q9Y5W8 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SNX13Q9Y5W8 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SNX13Q9Y5W8 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SNX13Q9Y5W8 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
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SNX13Q9Y5W8 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SNX13Q9Y5W8 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SNX13Q9Y5W8 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
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SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SNX13Q9Y5W8 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SNX13Q9Y5W8 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SNX13Q9Y5W8 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SNX13Q9Y5W8 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SNX13Q9Y5W8 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SNX13Q9Y5W8 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SNX13Q9Y5W8 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SNX13Q9Y5W8 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SNX13Q9Y5W8 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SNX13Q9Y5W8 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SNX13Q9Y5W8 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SNX13Q9Y5W8 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SNX13Q9Y5W8 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SNX13Q9Y5W8 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SNX13Q9Y5W8 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SNX13Q9Y5W8 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SNX13Q9Y5W8 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SNX13Q9Y5W8 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SNX13Q9Y5W8 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SNX13Q9Y5W8 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SNX13Q9Y5W8 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SNX13Q9Y5W8 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SNX13Q9Y5W8 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SNX13Q9Y5W8 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SNX13Q9Y5W8 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
SNX13Q9Y5W8 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.62□□□□□ -1.99
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SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SNX13Q9Y5W8 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SNX13Q9Y5W8 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SNX13Q9Y5W8 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SNX13Q9Y5W8 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SNX13Q9Y5W8 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
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SNX13Q9Y5W8 AC092017.2-201ENST00000427600 362 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SNX13Q9Y5W8 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SNX13Q9Y5W8 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
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SNX13Q9Y5W8 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
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SNX13Q9Y5W8 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
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SNX13Q9Y5W8 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
SNX13Q9Y5W8 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
SNX13Q9Y5W8 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SNX13Q9Y5W8 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SNX13Q9Y5W8 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SNX13Q9Y5W8 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
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SNX13Q9Y5W8 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SNX13Q9Y5W8 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
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SNX13Q9Y5W8 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
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SNX13Q9Y5W8 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
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SNX13Q9Y5W8 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SNX13Q9Y5W8 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
SNX13Q9Y5W8 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
SNX13Q9Y5W8 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SNX13Q9Y5W8 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SNX13Q9Y5W8 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SNX13Q9Y5W8 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SNX13Q9Y5W8 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SNX13Q9Y5W8 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SNX13Q9Y5W8 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SNX13Q9Y5W8 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SNX13Q9Y5W8 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SNX13Q9Y5W8 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SNX13Q9Y5W8 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SNX13Q9Y5W8 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SNX13Q9Y5W8 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SNX13Q9Y5W8 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
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