Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
HOXD1Q9GZZ0 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC1.98□□□□□ -2.09
HOXD1Q9GZZ0 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
HOXD1Q9GZZ0 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
HOXD1Q9GZZ0 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
HOXD1Q9GZZ0 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
HOXD1Q9GZZ0 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
HOXD1Q9GZZ0 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HOXD1Q9GZZ0 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
HOXD1Q9GZZ0 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HOXD1Q9GZZ0 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
HOXD1Q9GZZ0 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
HOXD1Q9GZZ0 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HOXD1Q9GZZ0 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HOXD1Q9GZZ0 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HOXD1Q9GZZ0 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
HOXD1Q9GZZ0 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HOXD1Q9GZZ0 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HOXD1Q9GZZ0 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
HOXD1Q9GZZ0 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HOXD1Q9GZZ0 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HOXD1Q9GZZ0 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HOXD1Q9GZZ0 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HOXD1Q9GZZ0 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HOXD1Q9GZZ0 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HOXD1Q9GZZ0 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HOXD1Q9GZZ0 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
HOXD1Q9GZZ0 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
HOXD1Q9GZZ0 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
HOXD1Q9GZZ0 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HOXD1Q9GZZ0 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HOXD1Q9GZZ0 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HOXD1Q9GZZ0 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HOXD1Q9GZZ0 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HOXD1Q9GZZ0 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
HOXD1Q9GZZ0 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
HOXD1Q9GZZ0 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HOXD1Q9GZZ0 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HOXD1Q9GZZ0 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
HOXD1Q9GZZ0 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HOXD1Q9GZZ0 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HOXD1Q9GZZ0 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HOXD1Q9GZZ0 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
HOXD1Q9GZZ0 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HOXD1Q9GZZ0 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
HOXD1Q9GZZ0 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC1.96□□□□□ -2.1
HOXD1Q9GZZ0 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HOXD1Q9GZZ0 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
HOXD1Q9GZZ0 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
HOXD1Q9GZZ0 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
HOXD1Q9GZZ0 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HOXD1Q9GZZ0 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.1
HOXD1Q9GZZ0 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HOXD1Q9GZZ0 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HOXD1Q9GZZ0 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HOXD1Q9GZZ0 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
HOXD1Q9GZZ0 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
HOXD1Q9GZZ0 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HOXD1Q9GZZ0 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HOXD1Q9GZZ0 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HOXD1Q9GZZ0 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HOXD1Q9GZZ0 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HOXD1Q9GZZ0 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HOXD1Q9GZZ0 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HOXD1Q9GZZ0 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
HOXD1Q9GZZ0 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
HOXD1Q9GZZ0 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HOXD1Q9GZZ0 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
HOXD1Q9GZZ0 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
HOXD1Q9GZZ0 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HOXD1Q9GZZ0 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HOXD1Q9GZZ0 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HOXD1Q9GZZ0 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HOXD1Q9GZZ0 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
HOXD1Q9GZZ0 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HOXD1Q9GZZ0 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HOXD1Q9GZZ0 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HOXD1Q9GZZ0 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HOXD1Q9GZZ0 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
HOXD1Q9GZZ0 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
HOXD1Q9GZZ0 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
HOXD1Q9GZZ0 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
HOXD1Q9GZZ0 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
HOXD1Q9GZZ0 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC1.94□□□□□ -2.1
HOXD1Q9GZZ0 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HOXD1Q9GZZ0 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC1.94□□□□□ -2.1
HOXD1Q9GZZ0 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HOXD1Q9GZZ0 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HOXD1Q9GZZ0 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
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