Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD8

RBM42, RNA-binding protein 42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM42Q9BTD8 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RBM42Q9BTD8 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RBM42Q9BTD8 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RBM42Q9BTD8 RN7SL98P-201ENST00000462271 300 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RBM42Q9BTD8 RN7SL176P-201ENST00000580352 264 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RBM42Q9BTD8 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RBM42Q9BTD8 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RBM42Q9BTD8 RXFP1-204ENST00000423548 3930 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RBM42Q9BTD8 RASA1-203ENST00000506290 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RBM42Q9BTD8 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RBM42Q9BTD8 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RBM42Q9BTD8 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RBM42Q9BTD8 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RBM42Q9BTD8 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RBM42Q9BTD8 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RBM42Q9BTD8 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RBM42Q9BTD8 SCN11A-202ENST00000444237 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RBM42Q9BTD8 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RBM42Q9BTD8 RPS26P47-201ENST00000427219 348 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RBM42Q9BTD8 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RBM42Q9BTD8 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RBM42Q9BTD8 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RBM42Q9BTD8 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RBM42Q9BTD8 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RBM42Q9BTD8 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RBM42Q9BTD8 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RBM42Q9BTD8 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RBM42Q9BTD8 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RBM42Q9BTD8 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
RBM42Q9BTD8 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RBM42Q9BTD8 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RBM42Q9BTD8 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RBM42Q9BTD8 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RBM42Q9BTD8 AC105940.1-201ENST00000434265 353 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RBM42Q9BTD8 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RBM42Q9BTD8 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RBM42Q9BTD8 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RBM42Q9BTD8 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RBM42Q9BTD8 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RBM42Q9BTD8 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RBM42Q9BTD8 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RBM42Q9BTD8 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RBM42Q9BTD8 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
RBM42Q9BTD8 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RBM42Q9BTD8 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
RBM42Q9BTD8 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RBM42Q9BTD8 ARHGAP42-201ENST00000298815 4752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RBM42Q9BTD8 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RBM42Q9BTD8 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RBM42Q9BTD8 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RBM42Q9BTD8 DTNA-229ENST00000598142 2509 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RBM42Q9BTD8 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RBM42Q9BTD8 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RBM42Q9BTD8 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RBM42Q9BTD8 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RBM42Q9BTD8 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RBM42Q9BTD8 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RBM42Q9BTD8 PARP4P3-201ENST00000510265 317 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RBM42Q9BTD8 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RBM42Q9BTD8 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RBM42Q9BTD8 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RBM42Q9BTD8 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RBM42Q9BTD8 OR1A1-203ENST00000641732 3832 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RBM42Q9BTD8 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RBM42Q9BTD8 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RBM42Q9BTD8 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RBM42Q9BTD8 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RBM42Q9BTD8 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RBM42Q9BTD8 RNU1-94P-201ENST00000362627 173 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RBM42Q9BTD8 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RBM42Q9BTD8 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RBM42Q9BTD8 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RBM42Q9BTD8 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RBM42Q9BTD8 AC023141.12-201ENST00000512399 199 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RBM42Q9BTD8 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RBM42Q9BTD8 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RBM42Q9BTD8 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RBM42Q9BTD8 AP002518.1-201ENST00000534904 3837 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RBM42Q9BTD8 AL163973.3-201ENST00000547093 430 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RBM42Q9BTD8 ZNF616-203ENST00000597013 577 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RBM42Q9BTD8 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RBM42Q9BTD8 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RBM42Q9BTD8 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RBM42Q9BTD8 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RBM42Q9BTD8 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RBM42Q9BTD8 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RBM42Q9BTD8 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RBM42Q9BTD8 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RBM42Q9BTD8 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RBM42Q9BTD8 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RBM42Q9BTD8 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RBM42Q9BTD8 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RBM42Q9BTD8 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RBM42Q9BTD8 AC084149.1-201ENST00000437233 284 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RBM42Q9BTD8 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RBM42Q9BTD8 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RBM42Q9BTD8 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RBM42Q9BTD8 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RBM42Q9BTD8 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RBM42Q9BTD8 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
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