Protein–RNA interactions for Protein: Q99966

CITED1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, humanhuman

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Length 193 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1Q99966 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CITED1Q99966 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CITED1Q99966 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CITED1Q99966 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CITED1Q99966 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CITED1Q99966 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CITED1Q99966 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CITED1Q99966 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CITED1Q99966 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CITED1Q99966 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CITED1Q99966 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CITED1Q99966 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CITED1Q99966 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CITED1Q99966 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CITED1Q99966 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CITED1Q99966 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
CITED1Q99966 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CITED1Q99966 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CITED1Q99966 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CITED1Q99966 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CITED1Q99966 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CITED1Q99966 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CITED1Q99966 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CITED1Q99966 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CITED1Q99966 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CITED1Q99966 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CITED1Q99966 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CITED1Q99966 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CITED1Q99966 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CITED1Q99966 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CITED1Q99966 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CITED1Q99966 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CITED1Q99966 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CITED1Q99966 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CITED1Q99966 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CITED1Q99966 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CITED1Q99966 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CITED1Q99966 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CITED1Q99966 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CITED1Q99966 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CITED1Q99966 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CITED1Q99966 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CITED1Q99966 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CITED1Q99966 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CITED1Q99966 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CITED1Q99966 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CITED1Q99966 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CITED1Q99966 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CITED1Q99966 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CITED1Q99966 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CITED1Q99966 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CITED1Q99966 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CITED1Q99966 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
CITED1Q99966 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CITED1Q99966 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CITED1Q99966 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CITED1Q99966 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CITED1Q99966 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CITED1Q99966 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
CITED1Q99966 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CITED1Q99966 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CITED1Q99966 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
CITED1Q99966 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
CITED1Q99966 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC1.52□□□□□ -2.17
CITED1Q99966 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CITED1Q99966 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CITED1Q99966 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CITED1Q99966 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CITED1Q99966 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CITED1Q99966 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CITED1Q99966 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CITED1Q99966 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CITED1Q99966 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CITED1Q99966 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CITED1Q99966 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
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CITED1Q99966 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
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CITED1Q99966 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CITED1Q99966 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC1.52□□□□□ -2.17
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CITED1Q99966 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
CITED1Q99966 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
CITED1Q99966 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
CITED1Q99966 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
CITED1Q99966 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
CITED1Q99966 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
CITED1Q99966 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CITED1Q99966 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CITED1Q99966 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CITED1Q99966 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CITED1Q99966 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CITED1Q99966 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CITED1Q99966 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
CITED1Q99966 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CITED1Q99966 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CITED1Q99966 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
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