Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 MIR3179-3-201ENST00000579566 84 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 MIR3179-4-201ENST00000617599 84 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC-0.83□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC-0.83□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 RNU6-226P-201ENST00000363778 107 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 Y_RNA.225-201ENST00000364326 97 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC-0.83□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 AL158050.2-201ENST00000605336 568 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.83□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 AP003072.5-201ENST00000623872 773 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC-0.84□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC-0.84□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC-0.84□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC-0.84□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC-0.84□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC-0.84□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC-0.84□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 AC055876.5-201ENST00000605667 259 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 RNU4-28P-201ENST00000364739 141 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC-0.84□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 AC013476.1-201ENST00000446709 537 ntTSL 4 BASIC-0.84□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 AC113398.2-201ENST00000507630 558 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC-0.84□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 AC018926.1-201ENST00000616335 435 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC-0.85□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 AL133217.1-201ENST00000450980 425 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 AC130415.1-201ENST00000547569 1010 ntTSL 4 BASIC-0.85□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 AC135803.1-201ENST00000608748 565 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 AC004223.4-201ENST00000612426 332 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC-0.85□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.85□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC-0.85□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 CEP70-205ENST00000464035 1054 ntTSL 1 (best) BASIC-0.85□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC-0.85□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 MTND5P31-201ENST00000419366 1374 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 DEFB133-201ENST00000398721 186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.85□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 AL365184.2-201ENST00000431139 435 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 snoU83B.1-201ENST00000517136 88 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.86□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 CXorf66-201ENST00000370540 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.86□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 Z99289.3-201ENST00000605586 594 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 ELOCP32-201ENST00000548625 324 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC-0.86□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC-0.87□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 HSFY7P-201ENST00000432672 318 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 HSFY8P-201ENST00000437934 318 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 HSFY5P-201ENST00000453726 309 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 LINC01674-201ENST00000427446 504 ntTSL 3 BASIC-0.87□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 TRBV8-1-201ENST00000481590 279 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
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