Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC1.19□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC1.19□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC1.19□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
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ZBED3Q96IU2 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC1.18□□□□□ -2.22
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ZBED3Q96IU2 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
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ZBED3Q96IU2 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
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ZBED3Q96IU2 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
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ZBED3Q96IU2 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC1.17□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.17□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC1.17□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC1.17□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC1.17□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 AC010620.1-201ENST00000601088 1102 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
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